唇腭裂是母亲在生长发育过程中一些不利因素造成的。这些因素可归纳为遗传因素和环境因素两大类，临床实践中经常发现唇腭裂患儿，在其直系或旁系亲属中，也有类似的畸形，这是由于某个基因的突变造成的。环境因素指的是胚胎生长发育的环境。母体是胚胎生长发育的温床，如果母体受到外界的干扰，就会影响胚胎发育。
可以通过手术到达良好的治疗效果的，但前提是必须按照序列治疗的程序进行治疗。可以利用咽后壁组织瓣增加软腭长度，利用咽侧组织瓣缩小咽腔宽度，以改善腭咽闭合。也可以利用裂隙邻近组织瓣封闭裂隙，延长软腭，将错位的组织结构复位，以恢复软腭的生理功能。
唇腭裂多是基因遗传性疾病，也有的是妊娠早期病毒感染、饮酒、药物及放射线引起的基因突变导致的。等宝宝大点可以采取手术的治疗方式，术后多休息，使用一些消炎药，预防消炎，伤口定期用消毒液消毒，不会影响美观的。
唇腭裂患者后代发生唇腭裂的机会是正常人的3-4倍，孕期接触不良环境也可引起唇腭裂，如孕早期接触放射线、服用感冒药等，由于患儿出生后即可表现出唇部或腭部裂隙、畸形，因此唇腭裂的诊断较为直观。若患儿仅腭部裂隙、畸形，患儿父母无法发现。但是患儿饮水或吸奶时，将发生倒流或呛咳，此时到专业医生处就诊，大多数可以发现。唇腭裂胎儿期，妊娠五个月后，即可诊断出。
有唇腭裂现象的婴幼儿，在喝奶的时候，使用专用的奶嘴来帮助喂奶，能够避免出现呛奶的现象，唇腭裂的患者最好是尽早的进行治疗，唇腭裂治疗的时候相对来说时间比较长，难度也比较大。
