怀孕空囊的原因，这要因人而异。可能是由于男性精子畸形而导致，也有可能是由于女性卵泡质量异常，或者是女性有支原体、衣原体感染，甚至是其他病毒感染，比如巨细胞病毒、弓形虫病毒都可能引起。
空囊多数情况是由于染色体异常而引起，也有可能是接触放射性物质引起，要进行清宫手术，在计划妊娠前三个月要口服维生素片，直到怀孕后三个月，可以有效的预防胎儿先天性神经血管畸形，避免接触放射性物质以防止致畸。
空囊妊娠是指胎儿发育的过程中停止发育，有染色体异常、受病菌感染以及黄体发育不足，还有其它疾病都能导致，要调理好身体，每天按时的锻炼身体，饮食要全民有营养。
一般情况下，怀孕两次都是空囊可能是疾病影响、不良生活习惯等原因引起的，具体内容如下：
1.疾病影响：如果女性存在生殖道感染的情况，或患有某些严重的内科疾病，如肝功能、肾功能障碍等，可能在疾病影响下出现怀孕两次都是空囊的情况。女性应及时就诊，明确病因后对症进行治疗。
2.不良生活习惯：如果女性没有养成良好的生活习惯，长期熬夜、酗酒、吸烟，也可能出现怀孕两次都是空囊的情况。女性应养成良好的生活习惯，可以适当运动，以增强体质。
如果只是偶尔一次，也有可能是精子或者是卵子质量不好，或者是说胚胎发育不好。只能观察看看。有偶尔一次胚胎停育或者是空囊，或者是生化妊娠，再继续试孕看看，如果是经常这样，系统的检查看看。
在临床上造成空囊的原因，常常是由于胚胎基因发育缺失所导致的。另外，如果孕妇有严重的内科疾病，也会导致胚胎停止发育，形成空囊的情况。还有环境的污染，比如经常接触有毒有害的化学物质，这样也会导致胚胎停止发育，形成空囊。所以，当胚胎停止发育，形成空囊的时候，临床尽早的终止妊娠，做清宫手术，并且在下次准备怀孕之前做详细的检查。
