口腔溃疡的治疗以消除病因、增强体质、对症治疗为主，治疗方法应坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合。口腔溃疡常呈周期性发作，复发时间长短与口腔溃疡病史长短有密切关系。
口腔溃疡可以通过药物进行治疗。口腔溃疡的治疗方法主要是祛除病因、增强体质、对症治疗，坚持全身治疗与局部治疗相结合，心理治疗与生理治疗相结合。口腔溃疡的局部可以使用喷雾剂或者西瓜霜局部适量的外用，同时要祛除口腔内的不良刺激因素，比如残冠、残根、不良修复体等。还要注意保持口腔清洁，每日正常刷牙、漱口，多吃水果、蔬菜，保证机体所需要的营养及微量元素。还要注意心理健康，时刻保持心情愉悦，不能有过大的心理负担。一般情况下，一周左右口腔溃疡即可愈合。建议去口腔科进行检查，根据诊断结果对口腔溃疡进行治疗。日常生活中应该注意口腔的保养，多吃一些清淡的食物，防止上火。
临床所见口腔溃疡大多为复发性口腔溃疡，因为局部疼痛，影响饮食、语言等会给生活带来很大的困扰，所以有口腔溃疡后应该及时治疗，减轻症状。其治疗原则是消除致病诱因，增进机体健康，减轻局部症状，促进溃疡愈合，但是目前还没有特效药物，所以治疗时应针对每个病例的致病诱因和对药物的反应，有侧重地采用治疗方法和药物。
小苏打不能治疗口腔溃疡，可以吃一些维生素片，或者是口里含一些淡盐水，起到补充维生素以及消毒杀菌的作用，然后在饮食方面，应多吃蔬菜和水果，以及一些有利于降火的食物，对口腔溃疡有辅助治疗的作用。
康复新液可以用来治疗溃疡，但因为是外用液体的药物，需要用纱布进行湿敷，所以不适合口腔溃疡的治疗。口腔溃疡主要症状是疼痛剧烈，常引起讲话及进食障碍。引起口腔溃疡的原因有很多，如精神紧张，压力大，维生素缺乏，微量元素缺乏。
孕期口腔溃疡需要通过局部治疗、日常护理等方式来治疗。
怀孕期间有口腔溃疡需要进行局部的治疗，同时需要在口腔科或者妇科专家的帮助下进行局部的用药，避免自行服用，导致自身和胎儿都出现异常。可以用生理盐水，不会造成任何的伤害，可以用来漱口，可以购买0.9%的生理盐水涂抹在口腔的创面，也可以用95%的乙醇来治疗，不过要在医师的指导下进行。
