灌肠可以局部用药，对全身的影响比较小，灌肠可以直接作用于消化道，对于孩子便秘、肠炎等引起的消化道问题，具有明显的改善、治疗作用。但是婴儿灌肠也有一定的坏处，如果灌肠操作不当，尤其是灌肠压力过大，会导致孩子出现肠穿孔。会导致肠道菌群的紊乱，因为灌肠的药物会干扰孩子的正常肠道菌群，从而引起肠道菌群的紊乱，孩子会出现便秘、腹泻等其他的消化道症状。
婴儿灌肠的好处是能够保证药物的使用时间，用药周期和药物剂量的准确。不受饮食哭闹等因素的影响，也没有像输液后的各种不确定因素影响。缺点是必须上医院，有专业人员操作。另外在操作过程中或者是操作不当，肛管容易造成肠道粘膜破损。长时间反复的操作，容易造成肛门失禁。
孩子观察好处就是没有明显的痛苦，用药后吸收也比较快，但是坏处也有的，很可能会导致梗阻或者胃肠道不适的情况，所以应该根据孩子具体的情况来制定合理的治疗方式即可，多休息。
灌肠用药可以避免口服，对于一些孩子抗拒用药，或者药物本身非常苦的情况下，灌肠可以让孩子能得到有效的药物治疗。灌肠的方法退热效果不确切，药物吸收率也不精确。同时，灌肠的时候会给孩子带来一些不舒服的感觉，而且有可能会刺激宝宝肛门和直肠，引起大便，导致灌肠以后药物很快排出。
提肛运动的好处有可以促进局部血液循环，预防痔疮等肛周疾病，增强腰、腹、臀、腿及盆腔肌肉，提高这些部位的肌肉及会阴部括约肌的功能。危害有容易造成括约肌疲劳，导致提肛硬度太大。
一般来说，灌肠治疗的方法主要适用于长期便秘的患者，其他患者一般不建议使用。
长期便秘体内的毒素不能及时排除，时间久了容易引发衰老、雀斑、痤疮等疾病。另外，长期便秘会引起肛裂、痔疮等疾病，甚至直肠癌、结肠癌等疾病，所以灌肠治疗可以预防上述疾病。一般灌肠药物主要是用一些生理盐水或者一些清热燥湿止泻的中药，效果很好。
