病人发生复发性口腔溃疡其原因较为复杂，至今均未完全清楚其发病原因。
但往往认为这是由多因素、共同作用所致，即复发性口腔溃疡为多因素疾病。很可能由遗传基因和免疫功能异常及社会环境因素三块因素综合造成。当然病人的精神压力太大、病人长期吸烟、病人口腔卫生差、病人饮食不均等也都是可以造成的。
建议在日常注意口腔护理，定期刷牙，减少口腔溃疡的发生。
口腔溃疡的发生主要与免疫力低下维生素缺乏感染有关，溃疡具有自限性，七到十天可以自愈，平时多吃蔬菜水果，补充维生素，提高免疫力，可以减少口腔溃疡的发生。反复发生的口腔溃疡，可以适当的用激素类药物进行治疗，平时不要吃辛辣刺激的食物。
复发性口腔溃疡发病原因除了口腔感染以外，还与自身免疫功能紊乱有关，所以治疗除了控制感染，还应该服用中药调理免疫功能，常用炙甘草汤加减治疗。中西医结合治疗，合理科学饮食，补充维生素和微量元素，注意口腔卫生，养成良好的生活习惯。
治疗复发性口腔溃疡采取全方位数字自动分析仪，口腔，细菌培养，免疫检查这些来明确病因，针对性的治疗的，主要是因为免疫失衡引起的，要从中医角度去提升自身免疫力，先要找准病因，然后再针对性对因施治。
复发性口腔溃疡与免疫因素有关，还有的人与遗传基因有关，发现有一半的人有一定遗传家族史，还有一部分患者与内分泌因素有关，比如女性患者在月经周期前后较容易溃疡发作。
造成溃疡的因素很多，精神压力大、经常有疲劳感、经常熬夜、或睡眠不足的人容易有溃疡。任何会引起免疫功能紊乱的因素，都可能诱发口腔溃疡。还有感染，比如细菌、病毒等微生物的感染，也是导致溃疡复发的重要原因。
