肛瘘常见的病因包括腹泻，上火，免疫力低下，比如本身有糖尿病等。最终导致肛门内部肛窦发炎，引起的肛瘘通常是需要手术治疗，或者内痔注射过深或手术后感染，产后会阴缝合后感染，前列腺、尿道手术后感染等，均可波及肛门直肠引起脓肿及瘘。
肛瘘多是非特异性感染的，少数为结核性的。要去当地正规专业医院检查病因后治疗。肛瘘是肛门直肠瘘的简称，是发生在肛门直肠周围的脓肿溃破或切口引流的后遗病变。肛瘘是脓肿后时代，是一个疾病的两个阶段。英文名Analfistula，中医称为肛漏。
肛瘘多数由直肠肛管周围脓肿引起，肛瘘是脓肿的后期，病人前期肛门处点疼痛没注意，脓肿破溃后，没有进一步治疗，感染就会像肛管的方向发展，形成肛瘘。肛瘘的病人一般用消炎药，外用药很难好，如果肛瘘要尽快到医院做择期手术治疗。
平时应养成良好的按时排大便的习惯，防止便秘，在每天早晨起床后立即大便。大便干燥时，可在每日清晨饮一杯淡盐水，忌食辛辣刺激性食物:痔疮的饮食注意事项。需要的就是调节饮食，吃些清淡易消化的，蔬菜水果，尽量不抽烟喝酒咖啡辛辣刺激食品，另外不要长久站立。不利于血液循环。
肛瘘的形成多见于肛隐窝炎，肛窦炎，反复的炎症感染刺激出现的肛瘘，一旦确诊肛瘘，治疗方案就是进行手术切除，尽量找到内外口，容易恢复高位的需要进行挂线疗法，注意局部的卫生，避免辛辣刺激的食物。
如果在急性期未能及时治疗，或者如果手术中内口不准确且恢复不好，则容易出现继发性肛瘘。对于单纯性肛瘘，可通过瘘管切除和持续换药来治好。在日常生活中，经常遇到许多患有复杂肛瘘的病人，需要多次手术和增加营养。
