可以保守治疗或手术治疗，具体要看病情决定。如果不是很严重，可以用药治疗，若症状严重可以进行微创手术，微创手术出血少，风险小，术后恢复也较快。要调理饮食，保持大便通畅，少吃不易消化的食物，以清淡营养为主，平时要多活动，不要久坐。
直肠粘膜内脱垂，可以采用提肛运动。若脱垂严重，应采取手术治疗。多吃新鲜的水果蔬菜，保持大便通畅。养成定时排便的习惯。热水坐浴，促进局部血液循环。禁食辛辣刺激性的食物，禁止饮酒。
通常情况下，慢性胃肠炎1-3个月左右才痊愈。
慢性胃肠炎以长期的病程为主，主要是由细菌或病毒感染所致。如果按照常规用药，一般一周左右就会好转，但是如果要让破损的胃肠道恢复到原来的样子，就必须要吃药了。此外，在服药过程中要避免食用辛辣、油腻、生冷一级不易消化的食物，以免影响药物的作用，从而延长治疗的时间。
小儿慢性胃肠炎的临床表现与胃粘膜病变的严重程度并不相符，而且病程会随着时间的推移而延长。
小儿慢性胃肠炎的症状以反复腹痛为主，没有规律，一般在进食后会加剧，且疼痛位置不明确，多见于脐周。小儿腹痛的主要表现是不稳定、进食和行为的正常变化，年龄较大的儿童则会出现上腹部疼痛，出现嗳气、早饱、恶心、上腹部不适、反酸、吃硬、冷、辛辣等食物，或吃了冷、辛辣等食物，导致病情加重。
少数儿童会有食欲减退、乏力、消瘦、头昏等症状，同时伴有胃糜烂的患者会有黑便的体征，一般不会很明显，疼痛的位置可能是在中上腹部或者是脐周。
一般情况下，慢性胃肠炎的症状有以下表现，具体内容如下：
慢性胃肠炎主要有胃粘膜、肠道粘膜炎症等，以慢性浅表性胃炎、慢性萎缩性胃炎为主。其主要症状为：胃口下降、上腹痛、嗳气、胃酸、上腹疼痛、反胃、呕吐等。如果患有慢性胃肠炎，患者可以在医生的指导下使用药物进行治疗，如奥美拉唑肠溶片、复方雷尼替丁胶囊、氢氧化铝片等，平时还应保持清淡饮食。
