女性非淋菌尿道炎可以通过药物进行治疗。
非淋菌性尿道炎主要是遵医嘱通过药物进行治疗，并注意局部的卫生。一般可以口服强力霉素、四环素等药物，具有消炎、治疗的作用。在用药的过程中要注意自身的局部卫生，因为非淋菌性尿道炎存在传染性，所以在治疗过程中要尽量避免同房，以免发生交叉感染。
非淋菌性尿道炎主要就是输液治疗，具体使用药物是需要根据患者的情况来确定，盲目用药物只会起到暂时缓解，后期病情还会反复出现，长期非淋菌性尿道炎没有及时的治疗是会诱发男性出现睾丸炎或者是前列腺炎。
淋菌性尿道炎可通过一般治疗或药物治疗。
建议患者多喝水，禁食辛辣食物和酒精，在治疗过程中不能同房，必须对被污染的内衣、浴巾进行消毒。如果出现排尿困难、尿道黏膜肿痛等症状，还需要积极在医生的指导下使用抗感染的药物进行治疗，比如头孢曲松和阿奇霉素。
淋菌性尿道炎复发患者一般采用抗生素进行治疗，具体分析如下。
比如用喹诺酮类的抗生素或者头孢类的抗生素，足疗程，一般都能达到较好的效果。当然，抗生素治疗前还要做尿液或尿道分泌物的微生物培养和药敏实验，如果经验性用药效果不好，可以根据药敏试验结果调整药物。对于复发的淋菌性尿道炎，应明确复发原因，防止复发。尤其是淋菌性尿道炎患者，应及时送医院进行检查治疗，只有同时治愈，才能预防淋菌性尿道炎复发。
非淋菌性尿道炎是淋球菌以外的微生物感染引起的尿道炎症。非淋菌性尿道炎一般无临床症状或临床症状较轻，可有尿道刺痛、排尿困难、尿道口少量粘性分泌物等。治疗可针对感染的病原微生物用药。必要时可以选择细菌培养加药敏，选择敏感抗生素进行治疗。治疗效果会更加好一些，正常可以选择一到两种抗生素，治疗1到2周时间去医院复查。
非淋球菌性尿道炎是由衣原体、支原体等淋球菌以外的其它病原体所引起的尿道急慢性炎症，因此在治疗上主要是使用抗菌药物。
由于这种尿道炎可以通过性接触传播，因此在治疗期间要采取防护措施，避免交叉感染。
临床上治疗非淋菌性尿道炎的药物有三大类，其中以大环内酯类使用最为广泛，常用的有阿奇霉素片、红霉素肠溶片等。此外，盐酸环丙沙星片、氧氟沙星胶囊等喹诺酮类药物，也可以用于非淋菌性尿道炎的治疗。
