慢性肾炎的治疗主要是应当以防治或者延缓肾功能进行性恶化、改善和缓解患者的临床症状以及防治一些严重的并发症为主要治疗的目标，而不是以消除患者尿中蛋白、红细胞为主要目标。
慢性肾炎分为四期。第一期为肾功能储备代偿期，肌酐升高，但不出现症状，容易治疗。第二期为肾功能不全期，这时肾小球已经有较多损害，肾脏排泄废物已有障碍，表现为疲乏无力，体重减轻，血压不稳定。第三期为肾功能衰竭期，这时肾功能损害已经严重，应及时治疗。第四期为尿毒症终末期，此时患者只能采用透析治疗或肾移植。
治疗原则主要包括以下几个方面：积极控制高血压，防止肾功能减退，预防心血管合并症。改善远期预后，可根据患者具体情况，选择ACEI或ARB一类具有降低尿蛋白作用的降压药物，控制蛋白质的摄入，避免感染、脱水、劳累、服用肾毒性药物，各种治疗需在专科医生的指导下进行。
慢性肾炎引起高血压首先要有效控制血压，另一方面要积极治疗或延缓肾损害生。高血压和肾炎同时出现中医认为主要调理肝肾二脏，可以选择“肝肾阴虚型肾炎治疗中成药”。
慢性肾炎的典型表现是血尿，蛋白尿，水肿，高血压，伴随有不同程度的肾功能减退，它的治疗目的主要是控制好血压，减少尿蛋白，延缓肾功能减退。在慢性肾炎的早期可以口服百令胶囊，海昆肾喜等药物保护肾脏，以及厄贝沙坦或者贝那普利等药物减少尿蛋白，控制血压。肌酐升高以后，可以口服尿毒清颗粒降低肌酐，当病情发展到尿毒症期，就需要透析治疗了。