完全性心内膜垫缺损进行手术治疗。如果患者出现肺动脉高压，肺循环阻力超过体循环阻力70%以上，可能要暂缓手术，或降低肺动脉压以后再进行手术治疗。其他患者一旦发现需早期进行手术治疗，手术包括关闭房室间隔缺损、修复瓣膜，减少瓣膜的反流。
完全性心内膜垫缺损能治好，一般这种疾病都是先天性的，只要发现的早，治疗的快，是能治好的。建议行手术治疗，孩子出现心脏病，及早治疗也能恢复的好一些，随着孩子增大，心脏的负担加重，手术更难。手术后要注意休息，不要劳累，而且还需要定期复查。
引起肺动脉高压的原因非常多，常见的引起急性肺动脉高压的有急性肺栓塞、急性的炎症性病变，都有可能会导致肺动脉高压。通过对原发病的积极治疗，肺动脉高压有可能会恢复到正常。
如果新生儿完全性心内膜缺损，属于先天性疾病。一般可通过手术治疗，但由于可以等他大一些再做治疗。平时一定要密切观察孩子情况。若有出现心跳急速或哭闹不停止，一定要带他到医院进行就诊。一定要通过母乳喂养，增强孩子的抵抗力。
肺动脉高压分为先天性以及继发性两种类型。如果为先天性肺动脉高压，主要是由于先天发育所导致的局部血管阻力增高诱发的症状，一般需要进行手术治疗。如果是继发性肺动脉高压，最常见于慢性阻塞性肺疾病所导致的肺心病，对于这类疾病，如果处于急性期，需要给予抗感染，改善通气以及改善心脏负荷的治疗。如果属于慢性维持期，则主要需要给予预防感染以及改善支气管痉挛，辅助排痰等治疗。
先天性心脏病肺动脉高压不能做手术。
先天性心脏疾病肺血管压力比较大，就是指肺动脉高压，是因为没有及时的诊断和处理，耽误了病情，才会造成这样的严重的后果。一般不能做外科手术。患者在医生的指导下使用万艾可、前列地尔等可以在一定时间内缓解病情。在日常生活中要多注意休息，防止出现心内膜炎症，从而导致病情加重。
