对于没有明显的临床表现，没有明显的临床表现是可以不必进行治疗的，这是由于病人的生命中没有明显的表现。若病人有临床表现，并有可能是因此病所致，可以服用美托洛尔，服用美托洛尔片；若病人的病情没有好转，可以转而使用维拉帕米。同时伴有心脏功能不全的病人也可以使用呋塞米片利尿；同时出现心律不齐的情况下，可以口服氨碘酮来提高心率。
肥厚性心肌病一般主要表现有呼吸困难、晕厥、心绞痛等症状。
肥厚性心肌病是一种原发性心肌病，检查时能够在心尖、胸骨左等部位，或者在第三、四肋间听得到粗糙的、收缩期的喷射样杂音。肥厚性心肌病发病一般可呈家族性或者散发性。大多数患者治愈后效果比较好，但如果患者出现左室流出道的梗阻，那会增加发生猝死的可能性。
出现不适时建议及时就医。
肥厚性心肌病的预后有较大的不同。
对梗阻性肥厚性心肌病（简称梗阻性心肌病），部分于青少年时期及活动期间突然死亡，部分逐渐发生心力衰竭（心衰），进展至终末期心衰（心衰），最终死于心力衰竭，感染及其他疾病。而部分病人（以非梗阻型肥厚性心肌病为主），临床表现较轻，大多在平时健康查体中被检出，对一般日常活动无影响，临床症状较轻，寿命与正常人相近。
肥厚性疾病的处理相对困难，以不一定能根治为主。
肥厚性心肌病以改善症状为主，降低并发症，防止猝死的发生，其中，药物治疗为肥厚性心脏病治疗提供了依据，以流出道梗阻为治疗目标的药物包括β受体拮抗剂，非二氢吡啶类钙通道阻滞剂等。当存在心衰时需针对心衰进行药物治疗，在伴有房颤的情况下，需给予抗凝治疗。对胸闷不舒服患者，应用硝酸酯类时，应引起重视，要排除外流道梗阻，以免用了以后加重病人的病症。非药物治疗以手术为主，酒精室间隔消融术为辅，及起搏治疗，对现在的病人普遍建议酒精室间隔消融，但还需结合适应症而定。
一般情况下，肥厚性心肌病首选β受体阻断剂比如美托洛尔、比索洛尔、拉贝洛。
此外，也可以用非二氢吡啶类钙拮抗剂以及ACEI或ARB类的药物来治疗。尔等，通过负性肌力及减慢心率作用，增加心脏回心血量，如果梗阻型肥厚型心肌病合并有心律失常，易导致猝死或卒中，可以加用抗凝药如利伐沙斑等。禁用硝酸甘油及洋地黄类药物。
肥胖性心肌病是一种不能剧烈运动的疾病。在青春期，运动时突然死亡主要由肥大型心肌病变所致，特别是阻塞型肥大型心肌病变。在阻塞型心肌病变中，由于左室收缩而使血液在狭窄的通道内形成了一个负压，使二尖瓣前部向前移动，使阻塞加剧，在收缩中期和后期尤为明显，尤其是在锻炼之后，这一现象就会加剧。对于不阻塞性肥厚的心慌、气短的人来说，要减少运动，要多休息，不要受凉。
