手术以后的饮食就非常重要，首先要进食容易消化的食物，多吃水果和蔬菜，尽量保持排稀便，纠正便秘，适当的进行功能锻炼。并且要避免暴饮暴食，每次在排便之后要及时的进行清洗，并且找医生进行换药。
如果是做手术，需要几十分钟的时间，肛瘘手术多长时间才能够恢复，要因病情而异、因人而异，比如体质好的人，可能一个肛瘘十几天就长好了，体质差的人可能得长20多天，30多天；好比说血糖高的，可能要长到两个月才能长好。
肛瘘是不会传染的。引起肛瘘的主要原因是因为长期喜爱食用辛辣刺激的食物或者长期饮酒、大便质地不成形、便次比较多，肛窦局部细菌滋生，细菌顺着肛腺管引起肛周的感染，形成肛周脓肿。
如果肛瘘患者不行手术治疗，瘘管内反复会出现急性感染，严重的会再次形成肛周脓肿，然后脓腔有可能会向周围组织再次出现破溃，从而将单纯性肛瘘变成复杂性肛瘘，增加手术治疗难度。还有由于肛瘘外口时常会有反复流脓肿痛，局部炎症的刺激有可能会导致局部的变性，甚至产生恶性肿瘤的可能。
一般不能自愈，即使病情再轻，都需要一定的处理，可能有的一些中医采用一些药物治疗，会有一定的疗效，病情较轻的治疗后不会再次发作；但多数病人，肛瘘会反复发作引起瘘管走行加深，可能会引起多个支管，所以一旦确诊为肛瘘，建议及时手术治疗，可能会有较好的疗效，避免病情迁延不愈，带来更为严重的并发症。如果病程过长，会使肛门括约肌纤维化，造成肛门失禁及肛门狭窄的可能。