这种病主要表现为肛门直肠疼痛和发热，直肠周围可触及肿块，伴有压痛和波动感（类似揉动装水的气球）。约半数的肛门脓肿会发展为慢性瘘（肛管直肠与肛门周围皮肤相通的感染性管道）。如不经引流，可延伸至邻近组织，也可进展为广泛的全身性感染。
肛周脓肿以疼痛和发热为主要的症状。肛周脓肿最主要的症状是疼痛，疼痛剧烈，且逐渐加重。脓肿自行溃破后，疼痛暂时有所缓解。低位脓肿出现剧烈肛门疼痛，且这种疼痛持续不减。直肠周围脓肿最主要表现是局部坠胀和便意感。发热常见，最高可超过40°。
肛周脓肿初期症状有哪些：主要是疼痛，最初为胀痛、化脓时跳痛、排便时疼痛加重，脓肿在肛门前方可发生尿潴留，脓肿在肛门后方出现尾骶部疼痛。全身中毒症状轻，局部肿胀，发红、压痛、有波动感。
主要是疼痛，最初的疼痛，化脓时跳痛，排便时疼痛加重，脓肿，在肛门前方可发生尿潴留，脓肿肛门后方出现在尾部疼痛，全身中毒症状轻，局部肿胀，红肿，压痛，有波运动。局部见肛门一侧，发红，肿胀，压痛，燃烧，痛苦的疼痛，活动和排便时疼痛加重，有排尿困难。
肛周脓肿主要是肛门周围疼痛、肿胀、有结块，发病很快。典型症状是肛门周围及臀部出现脓包，甚至屁股两侧都肿大，有的会阴部甚至也会发生脓肿。并且，会同时出现轻重不一的症状，如发热、困倦、坐卧不安等。甚至有病人会出现败血症的中毒症状。
肛周脓肿初期，病人先感到肛门周围出现了一个小硬块或肿块，继而疼痛加剧、红肿发热、坠胀不适、坐卧不宁、夜不能眠、大便秘结、排尿不畅，成里急后重等直肠刺激症状。并随之出现全身不适、精神疲惫乏力、体温升高、食欲减退、寒战高热等全身中毒症状。
