严重的口腔溃疡症状会有剧烈疼痛，影响病人进食、说话等，如果合并感染还会引起全身症状，病人会出现发烧，精神不济等症状。严重的口腔溃疡治疗需要全身加局部治疗相结合。
口腔溃疡的治疗主要是促进愈合，减少复发。促进愈合的治疗，主要有两个方面，一是预防感染，可以含漱抗感染的漱口水。二是促进黏膜修复，局部应用生长因子喷雾剂贝复剂，副作用较小效果好。特别是深大溃疡，长期不愈合的效果肯定；促进黏膜修复也可以局部应用激素，激素副作用较大，不能长期使用。减少复发，主要是西药调理免疫功能，中医中药辩证调理。局部减少创伤，防止形成溃疡。
蜂蜜可治疗口腔溃疡。效果甚好，且无痛苦。具体方法：晚饭后用温开水漱净口腔，用一勺蜂蜜敷在溃疡面处，含1一2分钟，再咽下，重复2一3次。第二天疼痛即减轻，连续治疗两天即基本就好了。口腔溃疡用筷子蘸蜂蜜一滴涂于口腔溃疡处，能在2小时内见效。一日数次，效果更好。
口腔溃疡的发生与免疫力低下，维生素缺乏感染有关，溃疡具有自限性，7-10天可以恢复，多吃蔬菜水果补充维生素，提高免疫力可以减少口腔溃疡的发生。反复发生的口腔溃疡，可以适当的应用激素类药物进行治疗，不要吃刺激的食物。
经常会长口腔溃疡的人，体内往往缺乏B族维生素。所以平时要有意识地多吃一些富含B族维生素，尤其是B1、B2的食物，如绿色蔬菜、糙米、番茄等。像辣椒、蒜等辛辣的食物则要忌食，以免刺激溃疡加重。
造成口腔溃疡的原因主要是免疫系统低，维生素和锌缺乏的缘故，所以平时饮食注意多样化，保证营养均衡，多吃富含维生素的蔬菜水果，多喝水，可以口服相关的药物，补充体内缺乏的微量元素。不要吃辛辣刺激的食物。
