核磁共振检查是脊柱系统疾病的一种非常常见的辅助检查方式，由于对软组织以及骨骼系统均有良好的成像效果，所以，主要用于检查脊柱脊髓神经以及周围软组织的病变。磁共振对于脊柱系统疾病的检查范围非常广泛，胸椎磁共振检查主要用于胸椎结核，胸椎的骨折脱位，胸椎段脊髓神经的病变以及损伤，胸椎及胸椎周围的良恶性肿瘤、转移瘤以及胸椎周围软组织、韧带的急慢性损伤等。
头部疼痛可以做CT检查，也可以做磁共振检查。做CT检查费用要低，但是存在一定的辐射，如果是孕妇或者小朋友，最好不要做CT检查。磁共振检查费用要高的多，但是清晰度比较好，做磁共振检查是在比较强的磁场里面，身体里面有钢钉、钢板或者心脏起搏器之类的东西也不能做检查。做磁共振检查是在空间比较大又比较幽暗的房间里面做，如果病人有幽闭综合征也不能做磁共振检查，只能选择做CT检查。建议到神经内科检查，在医生的指导下治疗。日常注意多休息，保持充足的睡眠，多喝水，注意保暖，避免着凉感冒。
腰疼拍CT还是核磁共振，需要根据具体情况来定：
第一种是腰椎间盘突出、腰椎管狭窄、腰椎压缩性骨折等疾病，可以采用CT扫描来明确诊断。第二，腰椎核磁检查的主要适用于高位腰椎间盘突出，以及多节段的腰椎间盘突出，一般CT不能完全反映腰椎的突出情况。所以当腰椎突出范围很大的时候，最好做核磁共振检查。另外，腰椎血管瘤、原发性腰椎、继发恶性等疾病，需要进行MRI检查，以明确病变存在部位、骨质破坏的情况。
一般情况下，小孩做脑CT和核磁共振有一定伤害，但是伤害较小。
小孩做脑CT，通常有一定的辐射损小孩的全身影响是比较小的，因为一次脑CT受到的辐射量通常是有限的，只要不是多次进行，一般不会造成较大的伤害。而核磁共振对于孩子的伤害则相对更小，因为核磁共振的成像一般和射线没有较为明显的关系，因次，也不会对小孩造成较为明显的辐射性损伤。
胸部核磁共振检查的费用并不高，一般也就50元-500元之间。但是各医院的收费标准不同，价格有点区别。做核磁共振检查的时候可能还需要配合血尿常规检查，因此在早上空腹去检查。
做ct还是做磁共振要看头疼的原因是什么，要根据头疼原因由医生决定。头疼做ct还是做磁共振需要就诊的医生进行判断，这两个检查各有自己的利与弊，ct作为常规扫描是没有问题的，一般颅内有血ct是可以直接检测出来的，但是一些早期或者更早期的脑梗塞ct是无法显示出来的，这就需要磁共振来进行检查，所以单纯头痛可以做ct，如果想要全面性的检查，建议磁共振头部的磁共振检查比ct更加能清楚的知道具体病情，做CT是可以看清楚硬组织如头颅骨头，而做磁共振能够看清楚软组织如脑部，ct有辐射，而磁共振没有辐射，所以如果只是单纯头疼，可以先做脑ct，根据检查结果，看是否需要做磁共振进一步检查。注意事项及禁忌：对于有心脏起搏器，体内有金属植入物及幽闭恐惧症者，是禁止做核磁共振检查的。