抗甲状腺过氧化物酶抗体高多是自身免疫性甲状腺炎导致的，如果是轻度或者中度程度的升高，则考虑甲亢等疾病。抗甲状腺过氧化物酶抗体是反映甲状腺自身免疫炎症的比较重要的一个指标。
甲状腺球蛋白抗体升高多见于甲状腺自身免疫性疾病。
桥本甲状腺炎和甲状腺功能亢进症患者，尤其是桥本甲状腺炎，甲状腺球蛋白抗体和甲状腺微粒体抗体明显升高，弥漫性甲状腺肿伴甲状腺功能亢进症，这两种抗体也可能升高，但主要升高的是甲状腺激素其余自身免疫性疾病，如多发性肌炎、系统性红斑狼疮、肌病等也可出现抗体升高，若出现抗体升高，应进一步对病因学进行检查，桥本甲状腺炎，注意是否出现甲状腺功能减退症，甲状腺功能减退症患者其余免疫性疾病，需对不同病原体进行准确诊断。
甲状腺过氧化物酶抗体高是因为体内存在慢性淋巴细胞性甲状腺炎，也是桥本氏甲状腺炎。这种慢性淋巴性甲状腺炎发病率还是很高的，当甲状腺过氧化物酶抗体增高的时候，如果甲功正常是不给予特殊处理的。
抗甲状腺过氧化酶抗体是监测甲状腺自身免疫性相关的一项指标。如果抗甲状腺过氧化物酶明显高，容易引起甲状腺的炎症反应，就是临床上的常见的桥本氏甲状腺炎。
一般情况下，怀孕了发现甲状腺抗体是(+)也比较高，可能与女性自身的免疫机能有一定的关系，也可能是甲状腺疾病的前兆，所以需要动态的观察和复查。
抗甲状腺过氧化物酶抗体高，说明存在甲状腺的自身免疫因素，也说明体内存在有抗甲状腺过氧化物酶抗体，常见于甲状腺炎，包括亚甲炎、急性淋巴细胞性甲状腺炎，或者简称为桥本甲状腺炎，所以此时要结合甲状腺功能测定结果以及甲状腺彩超，还有患者的临床症状来综合考虑是否治疗。
