肛瘘应该首选手术才能切除瘘管治好的，及时治疗，养成良好的排便习惯，每日排便后坐浴保持肛门清洁，对预防感染有积极作用。饮食上多吃含蛋白质类食品，如瘦肉，牛肉，蘑菇等。
治好肛瘘的基本标准就是肛门能正常排便，伤口基本愈合。在伤口愈合期需要注意保持大便通畅，尽量吃流质和软食。对于伤口严重愈合期时间会长一点，建议平日活动量减少，偶尔步行活动，增加肠蠕动即可。术后病人要注意随时监测体温，术后要保持肛门的清洁避免感染，遵医嘱给予一些肛门栓剂，或者每日药物清洗肛门。在术后第一次排便期，会感觉疼痛难耐，属正常现象，若是便秘可以用一些肛门润滑剂。
肛瘘多为化脓性感染所致，少数为特异性感染，如结核、克罗恩病、溃疡性结肠炎等感染亦可所致。最佳治疗办法可以手术处理。通常术后需要半月到一月时间恢复，手术观察期间一定要注意饮食生活作息，少吃辛辣刺激的食物，少喝酒，多注意局部的卫生清洗，勤换内裤。
肛瘘手术要忌辛辣刺激，多食新鲜蔬菜水果，少食多餐。预防大便干燥，每天温水坐浴，注意局部的清洁卫生，消毒伤口预防感染。需要注意营养来改善，同时需要注意休息帮助改善。
手术以后的饮食就非常重要，首先要进食容易消化的食物，多吃水果和蔬菜，尽量保持排稀便，纠正便秘，适当的进行功能锻炼。并且要避免暴饮暴食，每次在排便之后要及时的进行清洗，并且找医生进行换药。
