扁平苔藓可以通过电子显微镜和病理切片发现可疑的病毒和细菌，一般高黏血症与再生循环障碍与扁平苔藓有很大的关系，平时要注意保持愉悦的身心，不要有太大的压力，生活作息要规律，可考虑中西医结合治疗。
如果一些孤立性的皮肤损害，一般选择局部乳膏来进行治疗，如果皮损非常广泛的话，一旦停药之后，非常容易复发一般选择使用窄波紫外线或者是长波紫外线和光化学疗法来进行局部治疗。
口腔部位有扁平苔藓是由于真菌性的感染导致的症状，需要及时对症的使用抗真菌的药物来治疗，平时需要注意口腔部位清洁卫生，饮食上注意调养，不要吃生冷辛辣刺激性的食物。
外阴患上了扁平苔藓是一种真菌感染引起的，可以服用药物治疗，因为真菌感染后想根除是比较慢的过程，配合药物治疗才好，同时用药期间不能过性生活，如果有脚气可以一同治疗为好的，男性也要同时配合治疗的。
口腔扁平苔藓的发生主要是由于吸烟嚼槟榔等不良习惯有关，扁平苔藓是一种癌前病变，一旦发现需要及时的应用激素类药物进行治疗，平时养成良好的饮食卫生习惯多吃蔬菜水果，补充维生素提高免疫力。
治疗原则为减轻症状，促进愈合，防止复发和恶变等，口腔扁平苔癣是发生于口腔黏膜的一种慢性非感染炎症性疾病，最常发生在颊粘膜且呈左右对称性。口腔扁平苔癣病程较长，反复发作，可持续数年甚至数十年，时轻时重，且有癌变的可能。