治疗是以主动康复和被动康复为主，可以选择让医生来做床边康复，通过按揉局部肌肉防止和减缓肌肉萎缩的进展。也可以做针灸，通过针灸可以刺激肌肉延缓肌肉萎缩的进展。应该尽量配合医生做锻炼。
一般来说，肩周炎会引起肌肉萎缩。
肩周炎是肩关节囊及其周围韧带、肌腱和滑囊的慢性特异性炎症，主要有肩关节疼痛、活动不便等症状，是一种自限性疾病。如果不经干预治疗，肩周炎可能会导致肩关节活动减少，导致局部肌肉废用性萎缩，不是神经、肌接头的病变以及肌肉本身的病变导致，而是肩关节活动过少导致的。
患者日常应该规律作息，避免熬夜，注意休息，保持清淡饮食，避免食用辛辣刺激性食物。
滑囊炎是会引起肌肉萎缩的，目前可以吃点消炎、止疼药物的，也可以采取热敷来改善的，要注意休息，不可以过于劳累。滑囊是结缔组织中的囊状间隙，是由内皮细胞组成的封闭性囊，内壁为滑膜，有少许滑液。少数与关节相通，位于关节附近的骨突与肌腱或肌肉、皮肤之间。凡摩擦力或压力较大的地方，都可有滑囊存在。
小儿麻痹瘫痪期后如果瘫痪的肌肉在1～2年后仍不恢复，则为后遗症期，可能会出现足内，外翻，足下垂，脊柱侧凸和前凸，导致跛行，甚至不能站立和行走，影响儿童的生长发育，可以用手术矫正。
小儿麻痹后遗症是一种严重的致残性疾病，发病的结果造成患儿的肢体终身残疾。对这种疾病的治疗要从全面障碍和需要来处理，使他们得到全面的康复治疗，患病不仅身体而且精神和社会生活都应得到康复照顾和治疗，使他们和健康人一样生活、学习和工作。
现在有一种靶向修复，可以迅速的针对小儿麻痹症后遗症进行治疗，从内部修复受损的神经细胞，不会产生毒副作用，建议到专业的医院进行咨询，找到最适合的治疗方法。肢体肌肉萎缩无力、肢体变形、上下肢活动困难、关节不稳定、双侧肢体不等长等。髋关节挛缩屈曲或者松弛不稳，甚至形成髋关节脱位。膝关节屈曲畸形、小腿向内弯或者向外弯等均为小儿麻痹后遗症的症状。