脑干梗塞早期很难根治，如果超早期达到溶栓的适应症，可以进行溶栓，如果效果好，可以溶解血管中的血栓，让血管重新开放，不会留下较大的后遗症。
但对于梗死面积大，血管动脉硬化严重，不稳定斑块破裂的病人，即使提前进行溶栓，一般也会留下一些后遗症，比如吞咽困难，肢体活动不良，麻木，偏瘫，语言迟钝，饮水呛咳等等。
脑干梗塞和脑梗塞区别主要是梗死累及的部位不一样。脑干梗死指大脑的脑干部位发生梗死，脑梗死包括脑干梗死和大脑半球的梗死。脑干分为中脑、脑桥和延髓，如果这三个部位出现梗死，可以称为脑干梗死，也可以概括的说为脑梗死。
脑干是大脑的中枢，是人体的呼吸循环中枢，位置非常重要脑干梗塞的恢复时间因人，因梗塞的位置面积大小而异。脑干梗死是比较危险的，距离呼吸心跳中枢比较近，目前急性期还是以稳定病情为主，稳定一般2-3周，期间要预防并发症，比如肺炎电解质紊乱。具体恢复的时间也跟患者的身体素质有关。
脑干梗死严重。会累及到患者的意识，容易出现呼吸、心脏骤停甚至可危及到患者的生命。但并不是所有的脑干梗死都是非常严重的，脑干梗死的严重程度与否，与患者脑干梗死的部位、脑干梗死的面积都有密切的关系，比如延髓背外侧的梗死，容易有猝死的风险。
脑干梗塞比较严重,比其他部位梗塞的危险更大。脑干是人体的生命中枢,有呼吸、心跳中枢。一旦脑干梗塞的发生面积比较大,容易导致患者出现脑干水肿,进而形成脑疝,导致患者的延髓被压迫,容易形成呼吸、心跳骤停,危害到患者的生命。患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。
