宝宝腹泻可以贴外用的肚脐膏药，口服止泻药物来治疗。孩子腹泻严重很容易脱水引起低血容量性休克，不要在家里脱了，需要住院治疗，需要补水及补充电解质。饮食上注意清淡细软好消化的食物。
腹泻好多次，要先查明原因，患者可以到医院进行便常规，粪便细菌涂片及培养，再根据病因进行针对性治疗。
若为急性肠胃炎可给予诺氟沙星，黄连素和蒙脱石散。慢性之肠炎或结肠炎者，可给予肠炎宁和柳氮黄吡啶，溃疡性结肠炎者，则应给予美沙拉嗪或中药灌肠。腹泻较严重者，应给予甲氰咪胍，硫酸阿米卡星和氨基酸输液治疗。
小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
宝宝母乳性腹泻可能会持续6个月左右。
6个月后可以添加辅食，之后母乳性腹泻的症状会逐渐改善，直到完全康复。母乳性腹泻要注意宝宝身体状况，此时最好少吃母乳，多吃配方奶粉。6个月以内母乳喂养为主的宝宝常见母乳性腹泻，主要的症状是大便的次数增多，通常一天在6次内，大便性状呈黄色、绿色，或者是呈少量泡沫样。
如果宝宝仅腹泻，没有其他异常表现，可以口服蒙脱石散保护胃肠道粘膜及止泻，同时口服妈咪爱或者金双歧等益生菌调节胃肠道菌群失调及治疗腹泻。同时让宝宝适当的多饮水，避免宝宝脱水，并注意让宝宝尽量易消化饮食及加强腹部护理，避免腹部受凉，以免加重腹泻。如果宝宝有发热、脱水等异常表现，需要给予退热及补液等对症治疗。