可以使用2%到5%的碳酸氢钠涂抹口腔，改变酸碱环境，来杀灭病菌，可以在医生指导下，使用制霉菌素涂抹口腔，并且用药要足量、够疗程，才能取得好的效果。注意消毒卫生，避免交叉感染等。
一般情况下，宝宝长口疮用以下药：
宝宝长口疮，表现为口腔粘膜散在乳酪或豆渣样白色覆盖物。主要是因为身体抵抗力差，或是长时间服用抗生素引起的。尤其是抗生素滥用不规范时。此外，奶具和餐具的不合理的杀菌也有可能引起。宝宝长口疮可以通过避免诱发因素而逐渐消失，可以选择2%的苏打水进行治疗，也可以选择用制霉菌素和鱼肝油混悬液进行治疗。
婴儿长口疮，考虑是存在口腔溃疡，有以下几种治疗措施:第一种，建议多喝水，清洁口腔内壁，适当的喷洒西瓜霜喷剂，也可使用维生素c片或者克菌定含片敷于溃疡处，可以起到很好的治疗效果。第二种，考虑是由于缺乏维生素引起的，适当的补充复合b族维生素，局部涂抹口腔溃疡散，注意局部卫生，每次奶瓶要消毒，给孩子勤洗手。
一般情况下，新生儿鹅口疮能用制霉菌素片。
新生儿和6个月以内的婴儿感染白色念珠菌后，会在唇、舌、颊、软腭与硬腭等黏膜处，出现凝乳状的斑点或雪白色的片状假膜。这是家长遵医嘱，将制霉菌素片研碎后、制成混悬液，每2-3小时涂抹黏膜病损处，抑制念珠菌的生长。新生儿患有鹅口疮，家长要注意日常护理，妈妈要避免吃辛辣、刺激的食物。
口腔溃疡的发生主要与感染有关，一般七到十天可以恢复，平时多吃蔬菜水果，补充维生素，提高免疫力，可以减少口腔溃疡的发生。可以及时用相关药物进行涂擦，并且用漱口液改善口腔环境，平时养成良好的口腔卫生习惯，保持口腔的清洁，按时刷牙。
