病毒感染后在潜伏期、病毒血症期过后，因不同病毒致病机理不同、与器官组织亲嗜性差异、感染后病理损害和后果各异。但普遍存在如下变化：
1、溶细胞性感染：使被感染的细胞溶解坏死细胞的作用完全消失。
2、诱发免疫病理作用：。细胞毒性T淋巴细胞是对感染细胞的一种反应，通过各种细胞因子的作用导致感染细胞死亡。
3、细胞的转化作用：某些病毒感染细胞后，导致细胞增值增强。
4、潜伏与启动：有的病毒感染后长时期潜伏于组织细胞中，积极抵抗力下降时病毒复制又恢复活力。
5、不断带病毒状态：病毒可在机体内复制，而不会导致明显的病变及临床表现。
巨细胞病毒的感染分为先天性感染（宫内感染）和后天性感染；新生儿生后两-三周以内血清巨细胞病毒IgM和DNA阳性，一般判断为宫内感染。宫内感染主要会影响宝宝听力。宫内感染往往问题很多，而后天感染一般没有症状。
新生儿巨细胞病毒感染，需要处理及时，效果好，亦不免有后遗症，因此，防范尤为重要。
目前，我国有很多传染病已得到了很好的防治和控制，但仍存在许多潜在问题。考虑到传染的广泛性，多为隐性的，传播途径比较复杂，也不可控，加上易感染的广泛存在。因此要防止疾病发生和流行，首先必须采取综合防治措施。预防措施主要集中在研制疫苗上，做自觉身体素质练习，增强机体的免疫能力，同时增强抗病能力，尤其对育龄期的女性来说，为了减轻病毒、巨细胞病毒给胎儿带来的严重危害。
新生儿巨细胞病毒感染有宫内感染、围产期的感染两种。
1、宫内感染，即母亲在子宫中感染了巨细胞病毒，这种胎儿有可能会流产，也有可能是死胎。新生儿也有可能会出现神经功能方面的问题，或者是神经系统受到了伤害。
2、围产期的感染，这是由于围产期的宫颈、产道的逆行感染所致，有些孩子不会表现出明显的临床表现，有的孩子会出现呼吸系统和肝脏的损伤。
巨细胞病毒感染是人类巨细胞病毒导致的，是疱疹病毒的一种，在自然界中普遍存。
孕期初次或再发感染，病毒可会通过胎盘感染胎儿，即先天性感染。潜伏感染被重新激活或者不同抗原的巨细胞病毒感染，新生儿经产道吸入含巨细胞病毒的分泌物，或出生后接触到母亲含有巨细胞病毒的唾液、尿液、母乳，或者输血导致的感染，即围生期感染。出生感染的重要途径是母乳，因为母乳中巨细胞病毒排毒率大概是20%-70%，。
腹泻。该病毒感染会造成严重的腹泻。患儿常常发生水样腹泻，或者大便呈白色米汤样或黄绿色蛋花样改变。呕吐并发烧。由于肠道粘膜出现大量的炎症病灶，并且伴随有水肿，因此感染的迹象一般比较重，可出现呕吐、体温升高的现象。