输卵管囊肿通常是通过手术治疗的。如果早期没有得到有效控制，后期病情的发展可能会恶化。女性应该尽快去医院检查，找出病因，尽早治疗有效控制疾病发展。并根据检查结果进行有效的治疗。
输卵管囊肿手术三个月以后才可以怀孕，三个月后怀孕前也是需要先做个输卵管造影，检查一下输卵管是否畅通。如果畅通才可以考虑怀孕的，还需要做一个身体的全面检查，排除一下有没有其他疾病。
治疗可以通过药物手术还有中医治疗。较早的检查方法就是通液检查。顾名思义就是将管子与宫腔相连，注入药水，如果药水顺利通过输卵管则输卵管没有囊肿堵塞，反之则需要进一步检查了。还有是用输卵管造影检查。通过造影技术可以清晰地看到输卵管内部状态，相比第一种方法简单清晰，且副作用较小。
输卵管囊肿原因多由急性炎症发展而来。炎症使输卵管伞端和峡部粘连，炎性分泌物无法排出，积存而形成输卵管积脓。单纯的卵巢积脓比较少见。卵巢积脓也多因急性输卵管炎引起。输卵管卵巢囊肿多由经期产后，失于调理，致湿热、寒湿之邪乘虚侵入所致。因治疗不及时或不彻底，导致邪气留恋，与冲任气血搏结成瘀，形成输卵管囊肿。
女性在做了输卵管囊肿剔除手术之后，如果输卵管的功能正常，是可以再次怀孕的。但是有很多女性在手术以后输卵管形成瘢痕组织，导致输卵管蠕动功能有异常，此阶段容易出现宫外孕的现象。
