如果是细菌感染或寄生虫感染引起的肠胃炎，需要使用抗感染的药物进行治疗。病毒感染引起的急性肠胃炎主要是进行对症支持治疗和补液治疗，必要时进行抗病毒治疗。
患者需要及时前往医院就诊，明确病因后对症治疗，以免延误病情的诊治。治疗期间患者要养成早睡早起的习惯，不要吃辛辣、寒凉的食物，比如火锅、生鱼片等，可以适当增加营养的摄入，有利于病情的恢复。
肠胃炎患者会失眠。
一方面是肠胃炎，导致身体不适，出现睡眠障碍的现象，另一方面也是身体本身植物神经功能紊乱的原因。目前主要是尽快应用一些消炎药，配合保护胃肠黏膜的药物，也配合一些益生菌，促进肠胃炎尽快恢复改善失眠的情况。然后就是做好饮食，尽量流质饮食，不吃任何酸辣食物。同时也可以配合应用一些安神补脑的药物来调理失眠。
胃肠道功能不好与饮食习惯有关，需要进行饮食调理，给孩子生活规律，一日三餐按时定量进食，多进食水果蔬菜及易消化的粥类，汤类，避免吃油炸，烧烤，辛辣刺激食物。但如果是急性胃肠炎，有可能会出现上吐下泻，这个时候要赶紧带着孩子去医院，有可能是食物中毒，或者是吃坏的东西的。
应观察小儿有无发热，腹痛，呕吐及腹泻次数，性质及量等，有无流涕，鼻塞，咳嗽，咳痰，声音嘶哑等，注意有无小便少等脱水情况，注意有无烦躁或精神差等.及时告诉医生.除按规范治疗外，日常可注意好好照顾宝宝，按照医生嘱咐，喂养饮食，一般清淡易消化，每次量不要太多，尽量多喂几次.疾病一般都有一定的病程，也不要太焦虑，但如出现病情变化，应及时注意到，多与医生沟通。
胃肠炎的病人可以通过输液来改善体液平衡，比如输注体液、电解质等为主要成分的药物。
如果是由于细菌感染导致的胃肠炎，可以口服诺氟沙星、左氧氟沙星等抗菌药物。可以使用奥美拉唑等质子泵抑制剂来抑制胃酸的分泌，从而减少对粘膜的刺激，提高抗菌效果。如果是酸碱失衡，可以口服纠酸、纠碱的药物，如碳酸氢钠注射液等。
