引起神经元死亡和损伤的原因有很多种。外伤导致的脑血栓或者是脑出血。患有神经变性疾病，帕金森病和老年痴呆症、多系统萎缩等。感染性疾病导致的，比如病毒性脑炎。中毒也会导致神经元损伤。
肌肉萎缩不一定是运动神经元病。肌肉萎缩症在临床中比较常见，主要的病因有肌源性的肌肉萎缩，废用性的肌萎缩和神经源性的肌萎缩和一些其他不明原因导致的肌肉萎缩。不同的病因引起治疗方法也是不一样的。
肌肉的营养是靠神经的支配，神经元既神经细胞，神经元损害后会导致神经不能传导支配调节肌肉血供而发生肌萎缩也是当然的，严重时会发生瘫痪而危机生命。由于神经得不到充分的供血营养从而使神经功能症状进一步继发加重。
神经元受损，尤其是运动神经元的受损，会造成其相应支配区域的肢体等活动受限，长期的运动障碍加上血液供应障碍，营养障碍，就会出现肌肉的萎缩。比如按摩这些，其实就是刺激了神经元，有这个放电，这个电要通到肌肉里这个肌肉就能生长而没有神经剌激的肌肉就不会运动按摩也没用，所以按摩只是刺激了神经放电放激素去促进肌肉细胞生长，所以这个就像电器不能断电。
骨折后肌肉会出现失用性萎缩的状态，在骨折愈合以后，随着康复运动的逐渐进行，局部的功能会逐渐恢复，萎缩的肌肉会逐渐的发生代偿性的增大，恢复正常状态的可能性，这个是属于骨折期间的一个表现。不要过于紧张。
左腿出现肌肉萎缩最大的原因是外伤引起的，因为左腿部位的桡神经、尺神经、肌皮神经，这些神经出现明显的损伤，导致这些神经所支配的相关肌肉无法进行收缩以及舒张活动，时间长了之后，就会逐渐的萎缩，力量逐渐下降。
