儿童鼻窦炎通常可以通过一般治疗、药物治疗等方式进行治疗。
鼻窦炎是指鼻窦及鼻腔黏膜的炎症性疾病。鼻窦炎可分为急性鼻窦炎和慢性鼻窦炎。其中，以急性鼻窦炎最为多见。儿童鼻窦炎有急性与慢性之别。慢性鼻窦炎则主要是由于鼻内窥镜检查时发现有病变存在，且病情发展到一定阶段后才出现头痛、鼻塞等临床表现。急性鼻窦炎中，多数为上呼吸道感染所致。因此对急性鼻窦炎必须积极治疗。急性鼻窦炎处理不当，并复发转为慢性鼻窦炎。鼻窦炎的治疗应使用抗生素来控制感染。注意多休息，提高机体免疫力。
儿童过敏性鼻炎鼻窦炎咳嗽在治疗时，需要注意查明病因，然后进行必要的针对性的药物治疗和生活护理。
首先要明确其发病原因，采取有针对性的措施，比如：变应性鼻炎合并有鼻窦炎、上气道咳嗽综合症，应及时进行治疗。如果单纯的是单纯的花粉粉尘，可以通过使用组胺类镇静剂和鼻用激素来进行治疗，一般情况下是不需要服用止咳类的。
霉菌性鼻窦炎是一种常见的炎症,治疗比较麻烦，应及时就医找出病原菌,可通过手术治疗和药物治疗。
1、手术治疗,早期进行手术治疗能清除鼻腔和鼻窦内的真菌病原及坏死的病变组织,使鼻窦恢复通畅引流。
2、药物治疗，根据医生指导用抗真菌药物，如伊曲康唑。平时进行一些支持的治疗，如坚持锻炼增加身体抵抗力。
3、注意通过一些有效的方法控制疾病,不要有太多心理压力,去正规医院检查。少吃大蒜、洋葱等刺激性的食物，长期吃容易刺激到鼻腔,导致咳嗽或打喷嚏,使病情加重。
过程中要避免再次受凉，过度疲劳或感染。年龄较大的孩子，还可用蒸汽熏鼻或面部热敷，平时可以养成良好的饮食习惯，不可以暴饮暴食，要多喝水，吃易消化、富营养的无刺激性食物。生活要有规律，要注意多休息，保证充足的睡眠。多进行户外运动。不宜久坐。放松自己的心情。
副鼻窦炎可以口服鼻窦炎口服液治疗，同时可以口服或静脉点滴消炎药治疗，如果药物治疗效果不好，可以采取手术治疗，平时外出要佩戴口罩，以防冷空气吸入对鼻腔造成一定的刺激。
如果鼻窦炎反复发作，可以手术治疗。平时注意鼻腔卫生，养成早晚洗鼻的良好卫生习惯，注意擤涕方法。鼻塞多涕者，宜按塞一侧鼻孔，稍稍用力外擤。之后交替而擤。鼻涕过浓时以盐水洗鼻，避免伤及鼻粘膜。