非淋菌性尿道炎通常是好治疗的。
治疗非淋菌性尿道炎可采用抗生素药物和消炎抗感染等药物治疗，还可多吃有清热利尿作用的食品来协助治疗，从而达到根治的效果。非淋菌性尿道炎病人在治疗过程中，要注意尿道口干净、卫生，要天天用温水冲洗，不要久坐不动，同时还要保持良好的生活规律才能快速康复。
如果尿道有分泌物，并且已经被诊断为细菌性阴道炎，可以通过静脉注射抗生素来治疗感染。治疗期约为7-10天。同时，外用药物也可以用来冲洗局部区域。其次，应注意当地卫生，经常更换内衣，并将内衣暴露在阳光下。
非淋菌性尿道炎在早期会出现在长时间没有排尿或者是清晨首次排尿的时候尿道口会出现少量的粘液性分泌物，还伴有尿道刺痒，尿急，尿痛，排尿困难等症状。如果有出现以上症状，尽快到医院进行检查治疗。
非淋球菌性尿道炎是由衣原体、支原体等淋球菌以外的其它病原体所引起的尿道急慢性炎症，因此在治疗上主要是使用抗菌药物。
由于这种尿道炎可以通过性接触传播，因此在治疗期间要采取防护措施，避免交叉感染。
临床上治疗非淋菌性尿道炎的药物有三大类，其中以大环内酯类使用最为广泛，常用的有阿奇霉素片、红霉素肠溶片等。此外，盐酸环丙沙星片、氧氟沙星胶囊等喹诺酮类药物，也可以用于非淋菌性尿道炎的治疗。
非淋菌性尿道炎会出现尿道外口有浆液性、透明液体流出，伴有尿频、尿急、尿痛。如果合并有前列腺炎，也可以出现前列腺炎的症状，尿不净、尿等待、睾丸疼痛、会阴部疼痛等表现。
不能自愈。在患有尿道炎，洗澡的时候，可以用热水坐浴的方式去进行，这样能适当减轻尿道的疼痛感觉，也不至于细菌和微生物会随着水流，进入到尿道里面去，加重尿道炎的症状。需多饮水、多排尿。喝水能将尿道处的细菌及时排出，同时还需要注意休息。
