通常情况下，有宫颈囊肿可以通过药物、物理治疗、手术等进行治疗。
宫颈囊肿不大，也没有白带量增多、异味等，一般不需要进行治疗，要定期去医院做一次检查。如果宫颈囊肿数量较多，伴有白带量增多、有异味、外阴瘙痒等，可用消糜栓、苦参凝胶等治疗。药物治疗无效的，也可以选择利普刀、微波等物理治疗。另外对于囊肿体积较大的病人，可以进行外科手术治疗。
宫颈囊肿最重要的临床治疗是手术切除。具体致病因素尚不十分清楚。与个体免疫力低下、刺激外部化学环境的慢性炎症和刺激激素代谢直接相关。目前还不确定是哪个固定因素引起的，应该考虑病人的身体状况以及病情来进行治疗。
如果在怀孕之前没有卵巢囊肿，但是，怀孕后出现一侧或者双侧囊肿，可能是由于怀孕之后体内激素水平改变而引起生理性囊肿，如果不影响正常生活，也不影响怀孕，可以在怀孕之后在治疗或者观察等待。如果是其他性质的囊肿影响怀孕，就应该及时采取手术或者其他保守治疗。
出现宫颈囊肿，是属于宫颈的腺体口堵塞引发的，是属于一种慢性的良性病变的。每年做宫颈的液基脱落细胞和HPV的检查，如果这两项检查结果没有异常，一般没有多大问题的，如果平时伴发阴道分泌物较多，可以配合阴道内上药治疗。
宫颈囊肿一般是慢性宫颈炎或宫颈损伤刺激所引起。有宫颈囊肿时，如果平时没有什么异常的症状，只是在体检时发现，不需要特殊治疗。如果宫颈囊肿比较大或多发，或引起白带异常的症状，需要进行治疗。
