吃完肠虫清后并没有什么反应，大多数服用肠虫清后几小时会有驱虫效果，也有少数可能在一周左右才会有驱虫效果出现。一少部分服药以后会出现轻度头晕，头痛，恶心，腹泻，乏力，口干等症状，这是药物的不良反应。
两岁以上的儿童晚上服用2片。两岁以上的儿童单纯蛲虫、单纯轻度蛔虫感染，晚上服用1片，顿服。小于两岁的小儿禁用，严重肝肾、心功能不全和活动性溃疡病患者禁用；服用后可有的部分孩子可能会出现恶心、呕吐、腹泻、口干乏力、发热、皮疹、头痛，停药以后可自行消失。治疗蛔虫病史，偶见口吐蛔虫的现象。服用肠虫清时晚上不要吃油腻的食物。
一般情况下，小孩吃肠虫清有副作用。
孩吃肠虫清大多没有什么严重的不良反应，少数病例有轻度的头痛、头晕、恶心、呕吐、腹泻、口干、乏力等不良反应，是不需要处理的，它是可以自行的消失的，一般不需要特殊治疗，家长平时需要注意宝宝的饮食，均衡营养，同时还需适当带宝宝出门活动，能够促进宝宝身体的新陈代谢，让宝宝更快的生长发育。
肛门感觉有虫子在爬可能是真的有虫子在爬。常见的是蛲虫爬出肛门在肛门附近的皮肤处排卵，并同时排出分泌物，刺激肛周皮肤发生过敏性反应，引起湿疹，蛔虫幼虫和阴道滴虫同样会引起虫子在爬的感觉。也可能是肛门部疾病排出物或分泌物的刺激造成的异样感觉。
这种药物是一种杀虫的药物，能够使得肠道内的虫体分解，从而排出体外，是不会拉出整条虫子的。病人在口服肠虫清之后，要及时到医院就诊化验大便常规来明确有无虫卵排出体外。
一般来说，吃了肠虫清发现怀孕的影响是可能影响胎儿发育。
肠虫清是目前临床上最常见的抗寄生虫药，肠虫清的作用是低毒性，而口服肠虫清对胎儿的生长没有任何的影响。如果孕妇中有寄生虫或虫卵，那么可能会导致胎儿畸形。孕期定期进行排畸检查，可以在妊娠初期服用叶酸片，以防止神经管缺陷畸形。对于这个问题，最保险的办法是先做人工流产，然后停药，检查身体没有寄生虫感染。
