流脑是由于细菌感染的脑膜炎症，乙脑是由于病毒感染的脑实质的病变，也就是大脑炎。两种疾病所使用的药物是明显不同的，流脑通过自己的治疗，会完全康复的，大脑炎的病症比较严重，通过治疗部分患者，未留有后遗症状。
不会造成什么不良反应，也不需要再补打疫苗了。现在国家免疫规划疫苗是在8个月、和2周岁时接种乙脑减毒活疫苗。是免费接种的。而乙脑灭活疫苗是收费的二类疫苗，是家长自愿自费接种的疫苗。
一般情况下，宝宝接种了疫苗之后会发热，要根据发热的具体情况进行分析，比如咳嗽、打喷嚏、流鼻涕等，可以考虑是上呼吸道的疾病，可以口服小儿氨酚黄那敏颗粒、小儿头孢克肟、鲜竹沥口服液等药物进行治疗；宝宝出现腹泻、呕吐等症状时，可以口服妈咪爱、蒙脱石散、乳酸菌素片等药物进行治疗。体温38.5摄氏度以上要吃退烧药，没有明显的表现，可能是因为打了一针流感引起的发热，可进行物理降温。
第1个是发热，乙脑疫苗接种后发热的概率还是蛮高的，大概在10%左右，一般多是中低热，持续2-3天；第2个是过敏，可以引起皮疹、瘙痒等第。3个是引起胃肠道症状，可以引起纳差、腹痛、腹胀、呕吐、腹泻；第4个可以引起类感冒样症状，包括鼻塞、流鼻涕、咽痛等症状。除此之外，乙脑疫苗还有一些罕见的不良反应，包括白细胞的减少、淋巴结的肿大、过敏性紫癜等。
乙脑疫苗通常需要注射三次左右，因为注射三次左右才会产生抗体才会有免疫力，这样才可以有效的预防宝宝发生疾病。有些打完疫苗后没有产生很好的抗体还需要在注射一次，一定要按时给宝宝进行注射疫苗，打疫苗的时候也要在宝宝没有生病的情况下进行注射。
脑膜炎双球菌疫苗就是流脑疫苗，并不是乙脑疫苗，不能混为一谈，其实乙脑也就是们所俗称的流行性乙型脑炎。注射流脑疫苗是为了预防流行性脑脊髓膜炎。所以脑膜炎双球菌是流脑。
