甲状腺功能减退的治疗方法是甲状腺激素替代治疗，但在开始治疗前，必须确定这种甲状腺功能减退是否是永久性疾病。亚急性甲状腺炎后甲状腺功能减退一般为短暂减退，无需立即开始治疗。
另外，对于药物性甲状腺功能下降，停药后甲状腺功能逆转，无需立即进行药物替代治疗。对于永久性甲状腺功能减退患者，治疗目标是将血清促甲状腺激素水平维持在正常参考值范围内。治疗药物选择左旋甲状腺素片，治疗起始剂量因人而异。
婴儿出现甲状腺功能低下的情况一般是由先天性甲状腺功能不全所引起的。
与此同时，如果女性在怀孕期间患有严重甲状腺激素不足的病症的话，也是会诱发所诞下的婴儿甲状腺功能低下症状的，当然也可能是由家族遗传性甲状腺功能低下引起。但是无论是哪个原因引起的，都需要立即对新生婴儿进行诊治。否则，将来甲状腺功能低下会影响婴儿的智力发育，也会影响婴儿骨骼的发育。
一般情况下，甲状腺功能低下能否治愈需要根据病因进行判断，具体内容如下：
1.能治愈：单纯缺碘可能会造成患者甲状腺合成甲状腺素较少，导致患者甲状腺功能低下，此时，甲状腺功能低下是能治愈的，患者可以通过适量多吃含碘的食物来促进甲状腺功能恢复正常。
2.不能治愈：甲状腺手术、放射性碘治疗等可能会对伤甲状腺组织造成损害，导致患者甲状腺功能低下，此时，甲状腺功能低下通常不能治愈，患者需要终身服药，以控制病情，缓解症状。
新生儿出生后一般都需要在出生三天左右进行足跟血的采集，就是甲状腺功能低下的筛查。因为甲状腺功能低下有可能会对孩子的智力发育，体格的增长产生非常大的影响。
很多孩子进行检查，会发现有甲状腺功能低下症状，或者有促甲状腺激素水平升高或者偏低的情况。如果出现有数值的异常，考虑进行复查。很多孩子在进行复查以后都会有明显的改善，而且很多孩子是可以达到正常范围的。一般并不需要特别的治疗。如果复查之后仍然存在甲状腺功能异常，可以考虑应用相关的药物进行治疗。
甲状腺功能低下由于原因和表现都不相同。有些患者是由于做了甲状腺手术而导致的甲减，有些患者是由于桥本氏症导致的，有些患者是由于服用了一些药物而导致的。如果出现怕冷、心动过缓、少言懒言、心情低落等症状，建议去正规的医疗机构进行检查，医生会针对其甲状腺机能下降的程度，给予适当的治疗，同时给予甲状腺激素，使其恢复到正常状态，不会对工作、学习、日常生活造成任何的干扰。
有76%的人会有抑郁的表现，比如无助，往往先于身体的表现。
有些病人还会出现幻觉，幻想等心理疾病。在做完手术之后，还可能会导致患有抑郁症，如甲状腺炎、长期服用锂盐等。与此形成对照的是，约10%的忧郁症病人存在某种程度的低甲状腺激素，并且经常出现亚临床症状。无征兆的自体免疫性甲状腺炎，在接受锂盐疗法的病人和分娩病人中，都会出现轻度的甲减，这些都会使病人出现忧郁症。