对于肛周脓肿，西医常用的是抗生素，可以通过口服或者静脉点滴来进行治疗。
对于肛周脓肿，可以在浅浅的地方涂抹，如果是在皮肤比较浅的地方，那么就可以进行手术。反之，局部脓肿不是消失，而是扩大，或者是软化，就是已经形成了脓液，可以通过切口排脓。对于小儿肛周脓肿，父母要立即送到正规的医疗机构进行正确的处理，以促进病情的好转。上述药品需要在医生的指导下服用。
肛周脓肿是一种很常见的病症，也多发育儿童，但肛周脓周是一种需要外科治疗的疾病，是不可能自行恢复的。
如果只是单纯的肛周炎性包块，只要及时进行抗炎处理，就有可能痊愈。如果是肛周脓肿，可能会出现自然破溃而形成肛痿，此时需要做第二次手术。
肛周脓肿的另一种治疗方法是直接切开引流，也可以一次性根治肛周脓肿，但不能自己痊愈。
肛周脓肿初期症状主要是哭闹，接触肛门或排便时哭闹加重。随着脓肿形成，可以见到肛周红色肿块，起初肿块质硬，逐渐肿块中间变软破溃溢脓，形成肛瘘，这时患儿哭闹减少，破溃口会反复溢脓。
肛周脓肿属于感染化脓性疾病，但在感染初期，脓肿尚未形成时，可以采取保守治疗，少数肛周脓肿用抗生素，热水坐浴及局部理疗等可以消散。但是也要做好手术的准备，毕竟大部分肛周脓肿采用药物治疗是徒劳的。
宝宝患有肛周脓肿，属于外科病，需要去儿外科治疗，如脓肿明显需要脓肿切开引流治疗，黄疸2月仍不退，属于病理性黄疸。去医院挂儿外科看肛周脓肿，因为有肛周脓肿的高危因素，可能会引起败血症，黄疸有可能是败血症引起，应采血常规、血培养及脓液的细菌培养，来指导抗生素的治疗。
肛肠科的肛门镜检和指检，可以看出是否属于肛周脓肿及其分类；使用B超、CT、磁共振等先进仪器对其进行更深层次的检查，了解肛周脓肿的分类低位脓肿、高位脓肿和复杂程度，以及脓肿与肛门周围肌肉之间的关系，甚至发现深部脓腔和病变位置等。
