如果口腔粘膜的溃疡长时间不愈，应及时到正规医院或者医疗机构就医，行相关检查，以便明确诊断后对症治疗。平时应注意增强体质，减少感冒鼻塞等，补充足够的水分，清淡软食，少吃辛辣以及甜食，戒烟戒酒，按时作息。多吃蔬菜与水果。
清洁口腔后，用消毒棉签将蜂蜜涂於溃疡面上，15分钟左右后，可咽下，再继续涂拭，一天可重复涂拭数遍，也可以取一到三维生素片研成碎末，覆盖在溃疡面上，不到十分钟即可解除疼痛，不出半天就好了。这种治疗方法效果比较显著。
口腔溃疡的治疗以消除病因、增强体质、对症治疗为主，治疗方法应坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合。口腔溃疡常呈周期性发作，复发时间长短与口腔溃疡病史长短有密切关系。
可以用盐水漱口，局部用淡盐水棉棍清洗，然后用锡类散或者口腔溃疡散，拿棉花蘸涂到溃疡面上，1天涂2、3次，5天就好了。也可以用维生素B2碾成粉状撒到溃疡面上，还可以用黄连水煮的药水涂或者漱口，能够有效促进溃疡的痊愈。
反复发生的口腔溃疡一般是复发性口疮。研究表明复发性口腔溃疡与精神因素、机体的免疫系统、与病毒感染、消化系统疾病、工作压力大、持续性精神紧张等有很大关系。复发性口疮自身有自愈性，病程10天左右，口疮会自愈，但一但出现口腔溃疡还是要积极对症治疗，局部保持清洁，涂生长因子、溃疡膏、应用糖皮质激素、提高机体免疫力、减轻工作压力、适当休息、补充维生素等。
口腔溃疡可以考虑从全身和局部同时进行治疗。全身主要是提高身体的免疫力，吃些富有营养的食物，均衡饮食，保证睡眠。在局部主要是针对溃疡面的治疗，可以应用药物进行局部喷药，促进溃疡面的恢复，减轻疼痛的症状，缩短疼痛周期，使溃疡好的更快一些。
