松果体区的小型囊肿通常没有任何征兆，通常无需手术，但是需要经常进行检查。如果肿瘤体积增大，会对导管造成压力，导致阻塞性脑膜炎，可以行脑室-腹膜分流手术，以减轻其水肿。
此外，也可以在手术中应用松果体区囊肿-脑室造瘘术，对松果体区囊肿合并脑膜腔内窥镜下切除，既能减轻颅内水肿，也能消除病因，减少术后的并发症，效果良好。
绝大多数的生殖细胞瘤是可以治疗的。生殖细胞瘤主要是以生理异常发育为特征而引发的一种疾病。比较常见的治疗方式就是采用手术的方式，直接对生殖细胞瘤进行切除。当然也可以采用分流手术或者是立体定向活检这种方式来治疗。
儿童生殖细胞瘤，可能是病毒感染、物理因素等原因导致的。具体分析如下：
1、病毒感染：如果病毒改变了染色体基因的特性，使细胞原有增殖的特性发生改变，容易引起儿童生殖细胞瘤。
2、物理因素：如儿童受外伤或长期接触放射物质、化学物质，可能为诱发生殖细胞瘤素，瘤体的变化与接触放射物质紧密亲密相关，容易导致病情持续恶化。
一般情况下，小儿鞍上生殖细胞瘤要做头颅CT检查、肿瘤标志物检查等检查：
1、头颅CT检查：小儿鞍上生殖细胞瘤极少有钙化出现，多为实质肿物，头颅CT检查故对小儿鞍上生殖细胞瘤的诊断有一定价值。
2、肿瘤标志物检查：肿瘤标志物检查主要是通过脑室穿刺得到的脑脊液测定肿瘤标志物，比如甲胎蛋白、癌胚抗原等，阳性说明存在生殖细胞肿瘤的可能性。
一般情况下，儿童生殖细胞瘤要做影像学检查、肿瘤标志物、血常规检查等。
1、影像学检查：影像学检查包括腹部B超、CT、MRI等。影像学检查对于确定有无儿童生殖细胞瘤很重要。
2、肿瘤标志物：儿童生殖细胞性肿瘤好发部位肿块，伴有明显增高的甲胎蛋白提示肿块为生殖细胞性肿瘤可能较大，肿块甲胎蛋白组织化学染色阳性提示肿块内有恶性生殖细胞瘤成分。
3、血常规检查：大部分患儿白细胞总数和中性粒细胞计数升高，少数患儿可在正常范围内。
从肿瘤学的角度讲，将治好分为两个层次，认为肿瘤生存达五年以上即为治好，小儿生殖细胞瘤无法达到治好，肿瘤之所以能不受控制的增长或转移、复发，主要在于基因突变，带给患者自身无法控制的后果。