卵巢囊肿一般都是由于有附件的炎症，或者是有子宫内膜异位症导致的。中医来讲，是由于卵巢周围有寒湿，血瘀导致的，所以治疗起来一般都是活血化瘀，祛寒湿。另外遗传性加上饮食不当，内分泌失调，也有可能引起卵巢囊肿。
卵巢囊肿的消除应该视病情而定，小于五厘米又没有查到明显的肿瘤指证的病人，多为功能性囊肿，可以密切观察，2至3个月检查一次，视病情情况采用药物治疗，中药西药都有比较明显的疗效，肿囊肿直径大于五厘米，则多为卵巢肿瘤，对此应该采用手术治疗，卵巢囊肿的危害相对比较大，因此必须认真对待，积极治疗，可以到正规医院诊治。
可以考虑用保守治疗的方式，治疗期间精神压力不要过大，多注意休息，不能熬夜，养成一个良好的生活习惯。另外，平时也要多注意局部的卫生。要以纯棉宽松透气好的内裤为主。
如果囊肿尤其是月经干净后复查在五厘米以上，建议病人先明确囊肿是良性还是恶性，在怀孕前把囊肿去除；如果是良性的囊肿，且较小，一般是不会对胎儿有影响的。可以继续妊娠；如果囊肿很小，对排卵功能没有影响，那么就不会影响怀孕。
女性体内激素水平紊乱，或者妇科炎症都可能造成卵巢囊肿.
首先需要知道所患的卵巢囊肿是生理性卵巢囊肿，还是病理性卵巢囊肿。生理性卵巢囊肿是由于在排卵期后，由黄体期所形成的囊肿，一般是小于5厘米。在黄体期结束之后，激素水平下降，就会自动消失的，并不需特殊处理。而由于炎症导致，以及内分泌紊乱或者遗传因素所导致，还有子宫内膜异位症所导致的卵巢巧克力囊肿等，就需要根据病情来进行治疗。
