儿童慢性肉芽肿病主要是由先天性的白细胞功能障碍引起的。
儿童慢性肉芽肿病主要是由遗传的免疫缺陷引起的，一般会导致儿童不能产生需要的抗菌活性氧气。该病的传染途径和诱因均不存在。主要是基因物质的异常，而 NADPH氧化酶活力的减少或缺失，从而降低了吞噬细胞对氧的依赖性，同时也会导致吞噬细胞对细菌、真菌的杀灭，进而起反复的慢性感染。
一般来说，儿童慢性肉芽肿病有以下症状表现：
1.反复感染：患儿可能会出现耳和鼻周围皮肤湿疹样改变，逐渐进展为化脓性皮炎，还可能会出现瘢痕伴局部淋巴结肿大。
2.肺部感染：肺部是最常见的侵袭部位，一半以上的患儿因肺部感染首发症状就诊，部分患儿还会出现肺部反复感染的情况。
3.皮肤感染：部分患儿会出现皮肤破溃、化脓、局部肿块等症状表现。
4.肛周脓肿：肛周脓肿也是患者的典型症状表现，而且迁延不愈。
小儿慢性肉芽肿，可以抗免疫治疗，减轻免疫自身抗体的生成，减轻免疫性的损伤，如果效果不好，可以联合应用免疫抑制剂，可以减少炎症细胞和炎症介质释放，减轻免疫性的损伤，而达到治疗的效果。药物治疗的同时，避免辛辣刺激性食物，少食酸甜食物，避免油腻食物过多的饮食，一段时间观察看看。
可以通过饮食调节和药物治疗。出现皮下脂质肉芽肿病，一般是由于结节性脂膜炎引起的。主要表现为皮下出现结节，可以出现疼痛感觉的。要注意饮食控制，不要吃辛辣刺激性食物，一般可以自愈，必要时可以使用消炎药物治疗。
其主要的临床表现为皮损为结节或斑块，轻压痛。严重者可继发感染。要用非载体抗炎药，可是发热关键，关节疼和全身不适减轻，病情急性加重者应使用糖皮质激素，可实际体温下降，结节消失。皮下脂质肉芽肿病是表现为结节散在，消退后无萎缩和凹陷，无全身症状的结节性脂膜炎。
小儿慢性肉芽肿病患儿年龄较小，应以母乳喂养或配方奶喂养为主，可以添加辅食的孩子可进食营养丰富的食物，增强机体抗病能力。小儿慢性肉芽肿病患儿需注意适当的多吃富含维生素C以及蛋白质的食物，如肉、蛋、奶等，需要补充身体的营养，避免出现营养不良的情况。此外，还需要注意使用母乳喂养，要多给宝宝喝水，避免宝宝出现便秘的情况。