由于头颅内外组织结构中的痛觉末梢受到某种物理的、化学或机械性刺激，产生异常的神经冲动，经感觉神经通过相应的神经传导通路，传至大脑而感知。头痛可源于颅骨、肌肉、神经、血管等组织器官的病变，而很多头痛是某些全身性疾病的伴随症状。可以药物治疗。
有感冒的情况要进一步排除有没有脑炎，如果是脑炎引起的恶心头痛，要迅速办理住院，给予抗感染及规律治疗，如果有鼻窦炎的情况，需要ct检查排除鼻窦炎的情况，如果头痛比较厉害，可以颅脑磁共振检查，排除脑血管畸形的情况。
可能是包皮过长，龟头太敏感，如果平时龟头有摩擦内裤的情况下，就有可能会导致疼痛。另外也有可能是包皮过长，卫生清洁不到位，引起龟头炎，也会出现疼痛的情况，所平时多注意个人卫生，对龟头做些清洗。
主要是由于头部的血管、神经、脑膜等对疼痛敏感的组织受到刺激引起的。由紧张、疲劳、饮酒等原因造成的头痛经过休息之后可自然消退。头痛即可作为神经系统原发病的一个早期症状或中、晚期症状，如脑肿瘤病人以头痛为主诉者更是普遍；头痛也可以是颈部疾病，肩部疾病及背部疾病的症状，也可以是全身疾病在头部的一个表现形式，避免劳累，不要经常熬夜，另外要多吃坚果类食物。
头痛的发病机制复杂，主要是因为颅内外痛敏结构中的痛觉感受器，受到剧烈刺激，痛觉由传导通路传导至大脑皮层所引发的。颅内痛敏结构，包括静脉窦，颅底硬脑膜，迷走神经，脑膜前动脉及中动脉，舌咽神经，三叉神经。
