肾结石有的时候会感觉到腰疼，是因为小的结石活动范围大，当小结石进入肾盂输尿管连接部或输尿管时，引起输尿管剧烈的蠕动，以促使结石排出，于是出现腰疼，肾结石引起的疼痛可分为钝痛和绞痛，多数呈阵发性，亦可为持续疼痛。
在急性发作期的肾长结石就会出现肾脏绞痛，或者出现小腹部疼痛，临床上即使不排出体外，一般会持续24小时到48小时左右，但是肾结石在排出体外的时候，适当应用一些止痛药物或者消炎药疼痛就可缓解，平时要注意休息，不要多走动。
肾结石引起的疼痛是在腰部，在脊柱2侧，12肋骨下的位置，也就是肾脏在体表投影的区域，也称为肾区。如果是比较大的结石引起的疼痛，位置一般都局限在肾脏位置。但是如果结石比较小，落入输尿管后会引起肾绞痛，疼痛会牵扯至上腹部以及下腹部，绞痛出现时还会伴有恶心，呕吐的消化道症状，部分还会有血尿出现。
肾结石疼痛的部位如下，通常在后腰部或者是腹部，疼痛表现比较明显，有的感觉是腰部的酸胀或者不适，严重的时候，结石排出的过程中嵌顿在一个部位，会出现后腰部有刀绞一样的疼痛称之为肾绞痛，常常突然发作，排尿的过程中因为嵌顿然后导致突然发作，疼痛可以向下腹部或者腹股沟，还有大腿的内侧放射。女性可以放射到阴唇的部位。
肾结石疼痛在医学上被分为是11级疼痛，它是内脏疼痛。最严重的疼痛分级是12级，就是母亲的分娩痛。肾结石的疼痛是因为结石排泄过程中导致输尿管痉挛，肾脏积水，疼痛呈阵发性绞痛等。
