新生儿的消化道畸形主要是先天性肠狭窄和先天性肠闭锁，这种情况一般都是通过外科手术来治疗的。
外科治疗的原则就是要清除狭窄，按照狭窄的类型，可以分为肠腔狭窄和膜状狭窄，有些是因为肠外肿瘤压迫造成的。如有肝外压迫，应先排除压迫。如果有肠管狭窄，需要先切除肠管，再进行肠腔吻合。
建议在治疗期间多给新生儿补充营养，尽量母乳喂养。
先天性幽门狭窄可通过以下几种途径进行治疗：
第1种，手术治疗。手术切除对先天性幽门狭窄的疗效最好，应用也最为广泛。可进行幽门肌切开术。又因为先天性幽门狭窄属先天性消化道畸形。用药达不到疗效。
第2种，可通过日常饮食调节的方法治疗。但因此种疗法治疗过程较长，且疗效不如手术治疗好，故不是优先选择的方法。
一般情况下，先天性食道狭窄通过介入治疗的方式来治疗通常是能好的。具体内容如下：
微食道管壁畸形或结构异常等原因可能会导致患者出现先天性食道狭窄的情况，通常情况下，如果患者可以及时前往正规医院，在医生指导下通过介入治疗的方式来治疗，并且术后积极做好护理工作，那么通常是可以治好的。患者术后要注意休息，少说话，饮食宜清淡、软烂，禁吃坚硬、辛辣的食物。
先天性幽门狭窄可能是以下原因引起的。
先天性幽门螺杆菌感染是一种较为普遍的先天性幽门螺杆菌感染，其病因不明，主要与下列因素相关：
1、发育期间出现的幽门环状肌肉肥大；
2、感染病毒；
3、患者出生后，由于内分泌荷尔蒙的改变，引起了局部的环状肌肉增粗；此类儿童在出生后2~3个星期内会表现为恶心呕吐、进食后呕吐，呕吐中没有胆汁。
通常情况下，先天性食管狭窄会有食物反流、进食呛咳等症状表现。
1、食物反流：儿童在进食后出现反流、吞咽困难、进食困难、吞咽困难等现象。
2、进食呛咳：先天性食管狭窄常伴有进乳呛咳、吸乳缓慢、溢乳等，随着年龄的增加，会逐渐发生食管阻塞。儿童通常会出现生长缓慢、发育迟缓的现象。儿童的吸入性肺炎发病率随著年龄的增加而增加。
一般情况下，先天性幽门狭窄，患者可以通过手术治疗的方式进行改善，具体情况分析如下：
先天性肥大性幽门狭窄是一种器质性疾病，是一种不能用其他方法来治疗的器质性疾病，早期采用开腹手术，现在采用腹腔镜切除孩子的环状肌肉，对孩子的影响不大。此外，还可以通过儿童胃镜进入胃腔，在不损害儿童幽门周边粘膜的情况下，利用粘膜下隧道切开幽门肥厚环形肌。
