治疗小儿慢性肠炎看医生开药，吃药加调整饮食习惯，多吃一些蔬菜水果，避免吃一些零食以及生冷刺激的食物，平常要适当的锻炼身体，有助于改善症状。多给孩子做腹部热敷，腹部保暖。
一般情况下，患有慢性肠炎，可以采用药物治疗、生活护理等。
如果患有慢性肠炎，可以在医生的指导下使用药物进行治疗，如乳酸菌素片、苦参胶囊、盐酸米诺环素胶囊等，有利于缓解相关症状，促进身体恢复正常。在日常生活中，患者需要养成良好的生活习惯，注意休息，避免熬夜和过度劳累，适量吃蛋白含量丰富、易消化的食物。
小孩子得了结肠炎主要是腹痛腹泻等，这是一种常见的疾病给孩子做一个大便常规检查一下，然后给孩子喂点适当的肠胃药物，平时应该以清淡饮食为主，多给孩子喂点水，观察一下孩子精神状态。
慢性肠炎是细菌，病毒，真菌或寄生虫引起的小肠和结肠的炎症。表现为腹痛，腹泻，稀水样便或粘液脓血便。小儿肠炎多因不洁东西所引起，故预防最要紧的是食物之清洁及保存安全。
病人应该去医院做个肠镜检查。有一些疾病比较容易被误诊为慢性肠炎，比如溃疡性结肠炎，克罗恩病，结肠癌等疾病，这些疾病的临床表现都跟慢性肠炎类似，所以只有确诊了病情才能对症下药。
应减少喂奶量和延长喂奶间隔时间，暂停或减少辅食。人工喂养者可暂给稀释乳、米汤等易消化食物，然后逐渐增加乳量。注意观察呕吐及腹泻物的性质并记录次数和量以及排尿时间和尿量。勤换尿布、勤洗臀部，预防尿路感染和尿布性皮炎。