治疗包皮水肿需明确水肿原因后，对症病因进行治疗。如果发生包皮感染而出现水肿，这时需口服或静脉输注抗感染药物进行治疗。因手术外伤源性导致术后水肿或伤后水肿，则多为局部血液循环不畅引起的淤滞性水肿。此时需适度给予加压包扎，促进水肿吸收减轻水肿。
割完包皮水肿会在一周到四周的时间消退，水肿加重，消退则相对比较慢，早期卧床休息，每天对伤口进行换药，伤口换药时应该用敷料将包皮的创面进行有效的加压包扎，则不会发生水肿。
给予抗菌消炎、抗过敏治疗，可以使用热毛巾对包皮水肿的位置进行热敷，能够缓解水肿的症状。物理性因素的水肿可根据症状治疗，包括手术解除嵌顿，外伤创面治疗，中医对本病的治疗有较好的疗效，总的治则是清热解毒、收敛消肿。
割包皮水肿可以卧床休息，卧床休息减轻了阴茎的下垂，避免并减轻阴茎包皮的水肿。还可以适当的加压包扎也可以明显减轻术后的水肿，另外活动时，可以使阴茎朝上包扎，避免下垂，也可明显减轻包皮术后的水肿。
包皮环切手术以后，出现切口局部水肿，比较常见的原因是切口局部的感染，静脉和淋巴管回流受阻。或者包皮切口狭窄引起的可能性大。这是一种比较常见的情况，一般可以通过抬高龟头，配合理疗等进行治疗。理疗的方式主要是通过红光或者热敷等。一般水肿的消退周期是一周到一个月不等。若合并切口狭窄，则需要进一步处置。
包皮水肿是因为局部的血液循环不良或者是炎症的刺激引起的。可以用湿热毛巾热敷局部。补充含维生素b和维生素c，丰富的食物。不要喝酒，不要吃辛辣刺激的食物。遇有男性包皮过长或包茎时，强行翻开包皮，进行性交，从而使包皮局部受到强大的刺激，同时回流受阻，也会发生水肿。
