痛胃镜的副作用是比较小，主要是对咽喉部和消化道黏膜的损伤。无痛胃镜和普通胃镜的区别是无痛胃镜是在全麻的情况下进行，患者感觉不到痛苦，胃镜的前端穿越咽喉部时没有抵抗，减轻了对局部组织的损伤，但是也会对消化道黏膜造成轻度的损伤。
患者需要注意的是，应在专业医生的指导下进行检查，在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。
在做完无痛胃镜以后麻醉消除的时间和自身体质是有关系的，不是千篇一律的，恢复比较快的患者也就是做完以后也就是能够恢复了。可能也有半个小时左右的时间也就会恢复，超半小时以后没有苏醒的话，麻醉师会给患者一些疼痛刺激，使其尽快地恢复，麻醉的时候一般没有多大的风险。
无痛胃镜肠镜有危险，具体分析如下：
首先，就是麻醉的风险，虽然是速效麻醉剂，但如果用药不当，很可能会出现精神错乱、烦躁、缺氧缺血性脑病、植物状态、死亡等。另外，与普通胃肠镜相比，因为缺乏沟通，所以在手术中，肠镜会出现充气过多、进镜速度过快，从而增加肠穿孔和系膜的过度牵扯。这就要求有熟练的麻醉师和内窥镜医生配合，才能进行无痛胃肠镜检查。
无论是无痛胃镜还是普通胃镜，都存在着一定的危险性，而且会对身体产生一定的危害。因为无痛胃镜是在全身麻醉下行进行的，因此有可能会引起恶心、呕吐、呼吸困难等副作用，因此在做检查之前应该先禁食水8个小时。此外，在检查时，可能会对胃、食道、十二指肠粘膜造成损伤，甚至有可能造成食道、胃、十二指肠粘膜破裂出血。
通常情况下，做无痛胃镜的步骤是医生先通过静脉给予一定剂量的短效麻醉剂，帮助患者迅速进入镇静、睡眠状态，在毫无知觉中完成胃镜检查。由于患者在做无痛胃镜的过程中，由于是从口腔中插入胃管，做完无痛胃镜后，可能会出现现恶心、异物感、呕吐等不适，患者做完无痛胃镜后应注意休养，避免劳累，注意保暖，多喝热水，多食用清淡的高蛋白食物，促进身体恢复的同时，还能提高免疫力。
一般情况下，高血压病人在血压平稳后，可以做无痛性的胃镜，具体分析如下：
在做无痛性的胃镜之前，要先做好病人的健康情况，如果出现高血压，就要根据病人的情况进行治疗，等病人的情况比较平稳，再做无痛性的胃镜。高血压一旦失控，很有可能会在体检时血压骤增，还会导致心血管系统的问题，从而引发其它的一些并发症，从而对病人的身体健康产生不利的作用。不过，如果病人的血压已经平稳了，那么就会有很大的几率会有很大的降低，所以这种病人可以进行胃镜检查，同时还要注意自己的心情，不要过度的紧张，否则会造成血压上升，从而造成严重的后果。