一是切开骶尾部和腹部，把直肠盲端拖至会阴做成肛门。二是先在腹部作一个人工肛门等小儿长到1～2岁，再作切开腹部或骶尾部的直肠肛门吻合术。术后要注意孩子的营养，孩子外阴的卫生要保证好的，密切观察。
先天性肛门闭锁症又称锁肛，无肛门症，该病是先天性疾病.婴儿出生后即肛门，肛管，直肠下端闭锁，外观看不见肛门在何位置。一般根据类型选择不同的手术。如低位锁肛：常规消毒，不用局麻也可，只要将会阴部皮肤切开，稍加分离，然后进行扩张，就可以治愈。
一经诊断，根据情况选择行手术治疗。如会阴肛门成形，腹会阴肛门成形术，或低位锁肛：常规消毒。不用局麻也可。只要将会阴皮肤切开，稍加分离，然后进行扩张，就可治愈。因为孩子的年龄比较小，所以在手术之前一定要做详细的检查。
先天性肛门闭锁症又称锁肛无肛门症，婴儿出生后即肛门肛管直肠下端闭锁外观看不见肛门在何位置。一般可采用腹腔镜肛门成形术：通过腹腔镜在微创情况下，建立一条隧道，将直肠在会阴部做吻合，是最佳手术方式。或是低位锁肛或高位锁肛术等，是根据病情选择的。
一般是可以治疗好的。通常都是采用手术治疗。方法有腹会阴肛门成形术，尾路肛门成形术，腹腔镜肛门成形术，骶会阴肛门成形，腹会阴肛门成形，或会阴肛门成形：在会阴中央或可激发环形收缩区的中间,做X形切口，长约1.5cm，切开皮肤，翻开4个皮瓣，其下方可见环形外括约肌纤维。
