新生儿甲状腺功能低下的原因很多，有可能是孕妇患有甲亢，在孕期服用了过量的抗甲状腺药物，引起新生儿甲状腺功能低下；也有可能是胎儿先天性甲状腺不发育或发育不全；或者异位甲状腺。
新生儿先天性甲状腺功能低下的症状有：智力低下、表情迟钝、异常安静、不活泼、矮小、面部及手肿胀、聋哑、呼吸困难、黄疸、哭泣低、头发稀少干枯、四肢不温、脐疝、腹胀便秘、骨骼发育迟缓、胫骨上端及胸骨下端没有骺骨等。
治疗主要是补充甲状腺激素，即左甲状腺素钠片，可以通过系统的治疗2-3年之后，可以考虑停药1个月，再来检测甲状腺功能，假如甲状腺功能正常，也可能是暂时性的先天性甲状腺功能减退，也可以停药可以定期监测。
新生儿甲状腺功能低下症状，主要表现为：
1、初生儿童可表现为非特异性甲状腺功能减退。例如黄疸消退延迟、头大、皮肤粗糙、毛干、肚子大、对外界反应差、少吃少动、少哭闹、发呆，甚至伴有明显排便时间延长，或者伴有顽固性便秘。
2、随着月龄的增长，逐渐出现智力下降的症状。例如，外界对事物的反应能力下降，对人、对物的反应能力下降，追声、追物的能力出现明显落后于同龄儿童。如果不马上介入，大运动也会明显落后于同龄孩子。例如，如果在三个月内翻身，或者在六个月内坐下，就会明显落后于同月龄的孩子。
甲状腺功能低下是指甲状腺激素合成分泌减少，机体造成一个低代谢症候群。
甲状腺激素是维持人体正常代谢的兴奋性激素，甲状腺激素合成分泌减少，机体会出现低代谢综合征，患者记忆力减退，嗜睡，表情模糊，关节酸痛，体重增加，手掌和脚掌泛黄。女性出现月经紊乱，以月经量增加为症状，部分患者甚至出现不孕等。甲状腺激素降低累及心脏时，可能发生心包积液危及生命。甲状腺功能减退症时甲状腺激素水平下降，促甲状腺激素水平上升。
甲状腺功能低下，一般的是指甲状腺功能减退。主要是由于甲状腺功能异常，甲状腺实质性病变，下丘脑功能异常等造成的，也与生活压力过大，饮食不规律，没有良好的作息习惯，缺乏锻炼，饮食中含碘量过少等因素有关。
