脑脓肿治疗的时间，一般都很长，起码讲抗炎可能要4~6周，经过4~6周的抗炎，才能开展下一步治疗。
还需要根据患者影像学结果来观察其脓肿，是已接近切除，还是已被彻底包埋，之后患者症状是否得到了彻底缓解，进而确定是否需要持续抗炎治疗。
总之其抗感染时间，相对于其他的肺炎、腹腔等感染，治疗时间，大概相对长一点。
肛周脓肿只能手术治疗，如果不及时治疗，有可能演变成肛瘘。肛周脓肿一旦治好，不再形成肛瘘。尽早手术的原因是肛门周围组织较疏松，且间隙多，故当一个间隙发生感染后常会迅速波及到其他间隙，引起多个间隙的混合感染，所以肛周脓肿应及早手术治疗。
肺脓肿得治疗15天到20天。具体时间也需要结合病情的轻重程度以及个人的体质决定。出现肺脓肿之后，在早期要在医生指导下及时选择抗感染的方式进行改善，通常病程的时间很短，大概20天左右能够治愈。如果患者没有及时治疗，可能导致病情越来越严重，因此需要选择抗生素类的药物进行改善，整个病情可能会超过20天。也可能会成为慢性肺囊肿。
治疗肺脓肿的药物主要有青霉素类药物和大环内酯类药物。肺脓肿确诊后要及时进行治疗，首先要用抗生素进行积极的治疗，抗生素要覆盖厌氧菌，比如青霉素、甲硝唑、奥硝唑、克林霉素、林可霉素等，另外还要加强痰培养的检查，可以根据药敏试验更换抗生素。其次要重视痰液的引流，主要有体位引流和化痰的药物，氨溴索、桉柠檬碱、乙酰半胱氨酸等。如果出现高热症状，可以口服一些解热止痛的药物，比如美林、洛索洛芬钠、阿司匹林等。如果病人有休克症状，应进行静脉输液，并应用血管活性药物。
治疗肛周脓肿的方法有手术，且越早越好。肛周及会阴部可见片状黑色病变，皮下可触及捻发音，严重的大片皮肤及筋膜进行性坏死，波及阴囊、大阴唇，有的到达直肠下段、下腹部、后腰部，面积广，蔓延速度快。
前列腺脓肿可以进行抗菌药治疗，根据尿液脓液的细菌培养选用抗菌药，短期可控制病情。也可以采取会阴部前列腺穿刺抽脓术，也可以物理疗法，用热水袋放在会阴部做热敷，促进局部脓肿炎症消散。平时也要注意饮食护理，牛奶等可以提高免疫力的食物。
