较小而无症状的囊肿不必治疗，较大的囊肿或有症状的小囊肿可手术治疗。囊肿近尿道膀胱或突入膀胱用经膀胱手术切除或经尿道电切，去除大部分囊肿顶部使其充分引流。腹腔镜切除前列腺囊肿具有组织显露清楚、手术时间短、不易损伤盆腔组织、创伤小、不造瘘、出血少等优点，是治疗向尿道后方及膀胱颈突起的前列腺囊肿的首选方法。对于近尿道或突入膀胱的囊肿，经尿道电切除囊肿则是手术途径。
前列腺囊肿可以手术治疗，手术后注意休息，勿吸烟，饮酒，饮食要清淡，忌食辛辣刺心的食物，注意营养调配，保持正常的生活规律，注意休息，适当运动，增强机体抵抗力，防止感冒。
前列腺囊肿自身就是一种常见的疾病，常行B超检查，可见囊肿，前列腺囊肿治或不治，全凭病症，是否有病症是否导致生活和其他问题进行处理。
一般情况下，对于已经患有前列腺囊肿的患者，应该先检查出是否为良性病变，在进行药物或其他方法治疗后，再决定要不要治疗。若为前列腺囊肿较小且无症状者，无排尿困难，亦无尿路感染等，亦不会对精子射精产生影响等，所有这一切均可无需处理，持续观察年行B超检查，检查囊肿是增大还是变化之类即可。
如果在半年内出现尿频，尿急等情况，就要去看医生了，因为这类患者已经到了非进行药物治疗不可的地步。如有排尿困难等，重复尿路感染和导致射精障碍的原因，则需手术治疗。
有穿刺和手术治疗，还有效果不是很好的保守治疗。这是一种比较难治的病症，一般是通过引流使囊肿消失，达到治疗的目的。像这种复发率比较高，不可反复穿刺，这样会加大感染的几率。
前列腺囊肿可采取保守治疗和外科手术方法进行治疗。保守治疗可应用中药内服和外用贴敷等方法。外科手术电切，穿刺注射硬化剂等，选择治疗方案应根据囊肿大小，部位，病人年龄而定。对囊肿突向尿道，膀胱者，以内镜电切囊壁为宜；而对于前列腺腺体内及后方的囊肿，可采用超声定位经会阴或直肠穿刺抽液后注入硬化剂，定位要准确，囊肿大小决定进针深度，以针尖位于囊肿中心为佳。