一般情况下，妊娠妇女都会使用一些抗菌药物来治疗疾病，如青霉素类、头孢菌素等。
抗生素对细菌性结膜炎有优良的疗效，对病毒性结膜炎的治疗虽然无效，但还有防止细菌感染。在怀孕期间，由于胎儿的不断发育，身体抵抗力会越来越弱，很容易受到病菌和病毒的侵害而引起炎症，导致眼部发炎或视力下降等症状。因此，孕妇患结膜炎的话，眼药水和眼药膏都要专人专用。另外，在用药时要注意避免使用刺激性药物和激素类眼药品种，因为激素有刺激眼部黏膜和结膜细胞生长等不良反应。
孕妇若患有结膜炎，切不可盲目用药，必须尽快到医院在医师指导下使用药物。
一般情况之下，孕妇患的结膜炎都是属于急性炎症型，并且这种病症具有较高的发病率。尽管结膜炎并不严重，但若一味用药，常可使本病迁延不愈或反复发作。因此对于妊娠期间的女性来说，一定要特别小心避免患上这种眼病。平时要培养用眼良好习惯，用眼卫生，必须有足够睡眠，同时，饮食上也必须合理。另外还应该注意避免一些容易引起过敏或感染的药物，比如抗生素类、激素等。
大多数婴儿结膜炎是由细菌、病毒或衣原体感染等病菌引起的。细菌感染结膜炎可用妥布霉素眼药水、泰利必妥眼药水。干扰素、阿昔洛韦。更昔洛韦等药物，可用于病毒感染引起的结膜炎。红霉素眼药水可用于衣原体感染引起的结膜炎。另外，如果是过敏性结膜炎，可以选择糖皮质激素类的眼药水，如色甘酸钠滴眼液、帕坦洛滴眼液等。具体用什么眼药水，建议带婴儿去医院做眼科检查，在医生指导下使用药物。
幼儿结膜炎用什么眼药水需要根据具体情况来确定：
对于儿童的结膜炎，应该做一些眼科的检查，确定是否是炎症性结膜炎或者是过敏性结膜炎。其次要找出病因，细菌感染、病毒感染、衣原体感染等都是炎症性结膜炎，可以使用更昔洛韦或者是阿昔洛韦治疗病毒感染。利福平眼药水和红霉素眼膏是治疗沙眼衣原体的有效方法。避免过敏性结膜炎，避免接触过敏性结膜炎，使用奥洛他定等药物。
一般情况下，治疗儿童结膜炎的眼药水有盐酸左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、利巴韦林滴眼液、更昔洛韦眼用凝胶等。
如果是细菌性结膜炎引起的，这种情况可以遵医嘱使用抗生素类的滴眼液给儿童使用，比如盐酸左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等。如果是病毒性结膜炎引起的，这种情况通常需要遵医嘱使用抗病毒的药物进行治疗，比如利巴韦林滴眼液、更昔洛韦眼用凝胶等。如果是过敏性结膜炎造成的，则可以遵医嘱给儿童使用色甘酸钠滴眼液或者盐酸氮卓斯汀滴眼液进行治疗。
通常情况下，儿童慢性结膜炎用抗生素滴眼液比较好。
儿童慢性结膜炎比较常见，可能是不注意眼部卫生、用眼不良等因素引起的，家长可以在医生的知道下给儿童使用妥布霉素滴眼液、氧氟沙星滴眼液等眼药水比较好，具有抗菌、消炎的作用，能够有效缓解症状。此外还可以用红霉素眼药膏，通常也能缓解儿童慢性结膜炎的症状，通常副作用比较小。