可以通过手术治疗，阴茎的大小主要是受遗传因素的影响，真性男性阴茎短小症是多见于先天性，少数为后天的。先天症的有睾丸发育不全症又称克氏综合症。这类病人，身材高大而阴茎却短小，睾丸小，阴茎虽能勃起，且具有性欲、射精和遗精等正常性功能，但由于睾丸不能产生精子，所以排出的精液中无精子，因而无生育能力。
男人的阴茎的长短与种族，家族，遗传，以及青春期营养状况，地域，个体差异等有关。阴茎主要在青春期发育，过了青春期基本不再生长。如果要想增长，只有靠手术来延长或植入假体，药物延长的可能性不大。另外，阴茎勃起后达到8厘米就是正常。每晚睡前用指腹按摩阴茎，或用食指轻弹阴茎，每次15分钟或用温热毛巾紧裹阴茎，并用双手反复搓揉，每晚15分钟，为常用的自我康复疗法，阴茎短小的病人不妨一试。
阴茎短小可以做阴茎延长增粗手术的，可减少压力，但要有手术的适应症。选择正规的医院进行阴茎延长增粗手术，术后效果较好。平时可做增长阴茎运动，每天自我锻炼，一手摁住茎根，一手捏住龟头往上拉，反复多次。
阴茎短小是泌尿外科和男科比较常见的一种疾病。主要是指充分勃起后，阴茎的长度小于6cm，影响正常的性生活。比较常见的原因有阴茎先天性发育不良，隐匿阴茎，体重超标等因素引起的。通常通过视诊和局部标准测量的方式明确诊断，目前这个疾病主要的治疗方式是通过阴茎延长手术进行治疗。阴茎延长术一般可以延长阴茎的长度是2-4cm左右。
阴茎发育大小各人有差异，这跟人的身材一样，有高矮肥瘦方面区分，阴茎在勃起后不小于8厘米，那就不算短小，真正属于阴茎短小还是比较少见的。而对于成年人，阴茎发育已经定型，没有什么药物能够有确切增大增长的效果，若个人对阴茎大小不满意，可以考虑通过手术改善；如果身体较肥胖，可以先积极减肥。
成年以后已经很难再进行发育，一般只要勃起后超过九厘米，就算是正常的情况，另外性生活的过程中不短于两分钟也算正常。口服药物，如果药物治疗没有作用也可以选择手术治疗，但手术治疗的风险比较大。多食一些具有补肾固精作用的食物，如牡蛎，胡桃肉，栗子，甲鱼，文蛤，鸽蛋，猪腰等。