一般情况下，婴儿鼻炎每天凌晨三点咳嗽几声可能是以下原因引起的。具体分析如下：
小儿的鼻炎在凌晨出现咳嗽，很有可能是因为婴幼儿的过敏性鼻炎。也有一些原因是因为婴幼儿的急性鼻炎，这是因为病毒感染所致的鼻粘膜的急性炎性病变，会出现发热、鼻塞、流鼻涕等情况。当鼻液逆向流入咽喉时，会对咽喉粘膜造成一定的刺激，会导致咳嗽等。宝宝早上出现剧烈的咳嗽，也是因为孩子的胃内容物倒灌到了咽喉，会对咽喉粘膜造成一定的刺激。
可能由于饮食及生活不规律，胃粘膜损伤等导致。平时要规律生活，不要熬夜，日常生活中要注意饮食习惯，不吃油腻的食物，辛辣刺激的食物，生冷的食物。还要保持良好心态，情绪。
失眠可能属于神经衰弱的表现。神经衰弱是一种常见的神经病症，患者常感脑力和体力不足，容易疲劳，工作效率低下，常有头痛等躯体不适感和睡眠障碍，但无器质性病变存在。治疗要树立战胜疾病的信心、找出病因，对症治疗、积极参加体力劳动和体育运动、可以适当应用一些安神补脑的中成药，另外口服蜂乳、蜂王浆也有较好的疗效。
凌晨3点才睡觉属于严重的熬夜行为，大多数的激素在凌晨11点到1点之间分泌，此期间如果没有进入深睡眠状态，就会影响正常的激素分泌规律。因此长期的熬夜会导致内分泌失调，熬夜，过度疲劳可能诱发心律失常，导致恶性心律失常增加猝死的风险。
缺乏维生素锌或钙导致的，应该及时带孩子做个微量元素检测。应该带孩子去医院进一步进行检查才好，针对性采取下一步的治疗措施。同时多锻炼身体，多晒太阳。平时多给孩子喝点骨头汤，多吃点鱼，虾皮，海带。
凌晨3点左右醒来是早醒的一种现象属于睡眠障碍的一种，不等于是癌症。有情绪性疾病的患者就容易早醒，有严重的器质性病变也会干扰睡眠出现早醒。癌症也会干扰患者的睡眠，出现早醒，但不等于是癌症。早醒只是睡眠障碍的表现。
